新城疫病毒V4株F基因的克隆与核苷酸序列分析

文献类型: 中文期刊

第一作者: 曹殿军

作者: 曹殿军;郭鑫;苑纯秀;闫丽辉;闵平;刘培欣;卢景良

作者机构:

关键词: 新城疫病毒;V4株;F基因;核苷酸序列;二级结构

期刊名称: 中国预防兽医学报

ISSN: 23-1417/S

年卷期: 2000 年 22 卷 01 期

页码:

收录情况: 北大核心 ; CSCD

摘要: 本试验采用RT_PCR方法对NDVV4 克隆株V4(Hr)的F基因进行了扩增与克隆,并以Sanger’s 双脱氧末端终止法测定出其核苷酸序列,推导出氨基酸序列。F基因全长为1662bp,单一的开放阅读框编码553 个氨基酸的长肽。F蛋白的疏水构型有3 个强疏水区;F蛋白上共有12 个Cys 残基位点和5 个潜在糖基化位点。同其亲本毒株Queensland 相比,核苷酸同源率为99.3% ,氨基酸同源率98.7% 。上述主要功能区的序列完全一致,但其中7 个氨基酸的不同,的确导致了二级结构的变化(主要表现为α_螺旋、β_折叠、β_转角和β_卷曲的数量和位置的不同),而且单一的氨基酸差异足以导致二级结构的变化,如:214位的P对L的替换,就导致212 ~215 位连续的β_折叠变为一个α_螺旋和一个β_转角

分类号: S852.65

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