陆地棉叶绿体基因组密码子使用偏性的分析

文献类型： 中文期刊

第一作者： 尚明照

作者： 尚明照;刘方;华金平;王坤波

作者机构：

关键词： 陆地棉;密码子偏性;GC含量;最优密码子

期刊名称： 中国农业科学

ISSN： 0578-1752

年卷期： 2011 年 44 卷 02 期

页码： 245-253

收录情况： 北大核心 ; CSCD

摘要： 【目的】通过分析陆地棉叶绿体基因组密码子使用偏性,探讨影响密码子偏性形成的主要因素。【方法】以陆地棉叶绿体基因组为研究对象,利用Mobyle及其它软件,分析叶绿体50个基因密码子的使用模式。【结果】陆地棉叶绿体基因组密码子GC1与GC2之间的相关系数达到极显著水平,GC3含量最低,与GC12的相关系数为0.14,双尾检验未达到显著水平;单个基因ENC比值多分布在-0.05—0.05;对应性分析,第一轴上显示了10.27%的差异,与GC3、ENC的相关系数分别为0.223和-0.147,均未达到显著水平。【结论】陆地棉叶绿体密码子第三位偏好使用嘧啶,而最优密码子多以A或T结尾;密码子使用模式可能是由选择和突变及其它因素共同作用形成的。

分类号： S562

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