大灰象甲实时定量PCR内参基因的筛选

文献类型： 中文期刊

第一作者： 李晓

作者： 李晓;李建文;成波;李伟;孙文秀;高华援;鞠倩;姜晓静;杜龙;曲春娟;曲明静

作者机构：

关键词： 大灰象甲;实时定量PCR;内参基因;基因表达分析;表达稳定性

期刊名称： 昆虫学报

ISSN： 0454-6296

年卷期： 2018 年 11 期

页码： 1284-1294

收录情况： 北大核心 ; CSCD

摘要： 【目的】筛选出适合分析大灰象甲Sympiezomias velatus成虫不同组织中基因表达水平的内参基因。【方法】利用转录组测序技术获得大灰象甲管家基因序列作为候选内参基因,采用实时荧光定量PCR(qRT-PCR)技术分析候选基因在大灰象甲雌雄成虫触角、头、胸、腹和足中的表达量;并利用geNorm, NormFinder和BestKeeper软件及在线工具RefFinder评价候选基因的表达稳定性。以大灰象甲气味结合蛋白1(odorant bindng protein 1, OBP1)基因为目标基因验证候选基因在大灰象甲成虫不同组织中的表达稳定性。【结果】基于大灰象甲转录组数据首次鉴定得到β-肌动蛋白基因(ACT)、3-磷酸甘油醛脱氢酶基因(GAPDH)、18S核糖体RNA基因(18S rRNA)、60S核糖体蛋白L12基因(RPL12)、60S核糖体蛋白L32基因(RPL32)、40S核糖体蛋白S20基因(RPS20)、延伸因子2基因(EF2)、α-微管蛋白基因(TUA)和β-微管蛋白基因(TUB)共9个管家基因序列。geNorm分析结果显示,RPL12和RPS20是最稳定表达的内参基因,而BestKeeper和NormFinder分析结果显示最稳定表达的内参基因分别是TUA和TUB。综合各分析方法得出9个候选基因中TUB,TUA,RPS20和RPL12是最稳定表达的内参基因,而18S rRNA,ACT和GAPDH这3个广泛应用的内参基因则表现出最低的表达稳定性。最后以OBP1为目标基因对稳定性不同的4个候选基因进行稳定性验证,发现以TUB和RPL12为内参基因,OBP1在成虫不同组织之间的表达模式基本一致;而以RPL32为内参基因,表达模式与应用TUB作为内参基因时稍有不同,使用18S rRNA作为内参基因得到的OBP1表达模式则与应用TUB作为内参基因时的完全不一致。【结论】TUB,TUA,RPS20和RPL12可以作为分析大灰象甲成虫不同组织中基因表达水平的内参基因,为后续基因表达研究奠定了基础。

分类号： S433.5

  • 相关文献

[1]牧草盲蝽实时定量PCR内参基因的筛选. 贾冰,马亿,庞保平,单艳敏,鲍青龙,韩海斌,谭瑶. 2019

[2]双孢蘑菇内参基因的筛选与矫正. 赵建霞,沈颖越,冯伟林,金群力,宋婷婷,范丽军,蔡为明. 2019

[3]葡萄不同摘心处理下qRT-PCR内参基因的筛选与验证. 赖呈纯,潘红,张静,王琦,高慧颖,陈源,黄贤贵. 2019

[4]铝处理下绣球实时荧光定量PCR内参基因筛选及验证. 陈双双,齐香玉,冯景,陈慧杰,王华娣,秦紫艺,邓衍明. 2021

[5]茉莉花实时荧光定量PCR内参基因的筛选与验证. 齐香玉,陈双双,冯景,王华娣,邓衍明. 2020

[6]杂交兰实时荧光定量PCR内参基因的筛选. 林榕燕,钟淮钦,黄敏玲,樊荣辉,吴建设. 2018

[7]基于基因组和转录组数据的胡椒内参基因鉴定. 胡丽松,吴思婷,段兴帅,岑怡,苏岳峰,范睿,伍宝朵,郝朝运. 2020

[8]出芽短梗霉菌株PA-2胁迫下藜qRT-PCR内参基因的筛选与验证. 刘晓芳,程亮,郭青云. 2024

[9]基于高通量测序的梨果实常用内参基因表达稳定性分析. 王月志,戴美松,蔡丹英,施泽彬. 2019

[10]琥珀蚕内参基因的克隆及表达稳定性检测. 陈安利,钟健,刘增虎,李琼艳,廖鹏飞,杨伟克,董占鹏. 2018

[11]阳桃(Averrhoa carambola)实时荧光定量PCR内参基因的筛选与验证. 李笑平,朱雅婷,赵亚梅,陈蕾,任惠,吴沙沙,翟俊文. 2024

[12]高温胁迫下茄子qRT-PCR内参基因筛选及稳定性分析. 李植良,罗少波,陈日远,金庆敏,黎振兴,李德明,孙保娟,孙光闻. 2017

[13]多孢木霉HZ-31菌株胁迫下野燕麦内参基因的选择. 朱海霞. 2021

[14]玉米大斑病菌实时荧光定量PCR内参基因的筛选与应用. 代玉立,刘晓菲,甘林,兰成忠,滕振勇,杨秀娟. 2023

[15]荻草谷网蚜两个内参基因的克隆及表达谱分析. 张思宇,于苗苗,王文凯,范佳,陈巨莲. 2023

[16]植物实时荧光定量PCR内参基因的特点及选择. 袁伟,万红建,杨悦俭. 2012

[17]湖羊小肠黏膜内参基因筛选. 马志远,翁秀秀,李飞,李发弟,王维民,刘婷. 2015

[18]印度谷螟实时荧光定量PCR内参基因的选择. 唐培安,张棋麟,薛昊,袁明龙. 2016

[19]尖裸鲤实时荧光定量PCR内参基因的筛选. 孙海成,吕晓楠,佟广香,尹家胜,薛淑群,张丽娜,韩英. 2019

[20]岩牡蛎正常和低盐胁迫下定量PCR内参基因的筛选与验证. 宫建文,李琪,于红. 2019

作者其他论文 更多>>

微信小程序