绵羊母源基因TRIM28克隆、表达及生物信息学分析
文献类型: 中文期刊
第一作者: 罗健
作者: 罗健;王立民;张译元;郭延华;唐红;周平;刘守仁
作者机构:
关键词: TRIM28;Zfp57;母源基因;DNA甲基化;生物信息学
期刊名称: 石河子大学学报(自然科学版)
ISSN: 1007-7383
年卷期: 2017 年 02 期
页码: 139-145
摘要: 为了研究TRIM28基因在绵羊早期克隆胚胎发育过程中基因组去甲基化与重新甲基化及其维持的机制,探索母源关键基因在体细胞克隆效率中的作用,本研究通过提取中国美利奴细毛羊卵巢组织RNA,经反转录获得cDNA,利用特异性引物扩增TRIM28基因编码区序列,测序后采用生物信息学软件对编码区序列及氨基酸序列进行相关生物信息学分析和结构预测,进一步采用RT-PCR对绵羊不同组织中TRIM28表达量进行检测。结果显示:克隆获得了绵羊TRIM28基因编码区序列全长2441bp,编码811个氨基酸。生物信息学分析结果表明,不同物种TRIM28基因编码区核苷酸和氨基酸序列具有较高保守性。组织表达谱结果显示,TRIM28 mRNA在中国美利奴细毛羊肺脏、脾脏和卵巢中高丰度表达,且与Zfp57表达情况一致。结论:TRIM28基因结构和进化方面高度保守,推测其在不同组织中行使转录中介因子这一特定的生物学功能相关,TRIM8与ZFP57复合体在分化组织中对基因组甲基化的维持起着重要作用。
分类号: Q78`S826
- 相关文献
[1]植物DNA甲基转移酶的生物信息学分析. 吴春太,李维国,高新生,张晓飞. 2010
[2]小鼠胚胎母源基因转向合子基因组的转换起始点. 肖红卫,华文君,华再东,任红艳,张立苹,郑新民,朱喆,毕延震. 2019
[3]BCB筛选后的绵羊卵母细胞中母源基因mRNA表达量的差异性分析. 王静,石庆华,林嘉鹏,陈博,汪立芹,赵云程,黄俊成. 2010
[4]玻璃化冷冻对绵羊卵母细胞中母源基因mRNA表达量的影响. 王静,林嘉鹏,石庆华,陈博,汪立芹,赵云程,黄俊成. 2011
[5]母源基因Gdf9、Zar1、Mater和Dnmt1 mRNA在绵羊卵母细胞和早期胚胎中的表达. 侯敏,林嘉鹏,白洁,赵云程,汪立琴,陈世彬,叶小芳,黄俊成. 2010
[6]动物印迹基因与胚胎发育关系的研究进展. 王世锋,陈静波,刘明军. 2011
[7]犏牛及其亲本IGF2基因mRNA表达水平、DNA甲基化状态差异分析. 刘振山,李齐发,张庆波,屈旭光,董丽艳. 2009
[8]不同倍性西瓜基因组DNA甲基化水平与模式的MSAP分析. 王春国,古瑜,陈成彬,焦定量,薛振毅,宋文芹. 2009
[9]火龙果MSAP体系的优化及组培苗DNA甲基化检测. 刘鹏飞,乔光,刘涛,彭志军,蔡永强,晓鹏. 2016
[10]逆境胁迫下植物DNA甲基化变异的研究进展. 徐妍,张海玲,徐香玲,张会新,姚琳,张必弦,王全伟. 2014
[11]氮胁迫下高羊茅基因组DNA甲基化的MSAP分析. 王小利,王茜,舒健虹,蔡一鸣,刘彬,吴佳海. 2015
[12]干旱驯化后节水抗旱稻苗期不同发育时间DNA甲基化模式变化分析. 郑小国,陈亮,楼巧君,夏辉,李明寿,罗利军. 2014
[13]DNA甲基化及其生物学功能. 沈秀平,林月霞,徐琪. 2012
[14]表观遗传学研究方法进展. 郑小国,陈亮,楼巧君,罗利军. 2011
[15]DNA甲基化对植物生长发育的调控研究. 周颖. 2015
[16]植物中表观遗传修饰研究进展. 郑小国,陈亮,罗利军. 2013
[17]干旱胁迫对老芒麦DNA表观遗传变化的MSAP分析. 闫伟红,马玉宝,陈云,王凯,孟庆伟,张晶然. 2016
[18]急性温度胁迫对虾夷扇贝(Patinopecten yessoensis)基因组DNA甲基化的影响. 吴彪,杨爱国,孙秀俊,刘志鸿,周丽青,宫一震. 2016
[19]Islet-1诱导成纤维细胞系C3H10T1/2向心肌细胞分化过程中组蛋白乙酰化与DNA甲基化在GATA4启动子区的关系. 王越,朱静,田杰,许皓,易勤,赖星宇. 2016
[20]虾夷扇贝选育群体与野生群体基因组DNA甲基化的MSAP分析. 吴彪,杨爱国,董迎辉,郑利兵,刘志鸿,周丽青,孙秀俊,郑言鑫. 2015
作者其他论文 更多>>
-
绵羊季节性发情性状核心基因和关键lncRNA的筛选与分析
作者:杨杨;李良远;万鹏程;卢守亮;刘长彬;杨华;王立民;代蓉;周平
关键词:绵羊;季节性发情;RNA-seq;核心基因;lncRNA
-
绵羊MYL基因家族的鉴定与组织表达分析
作者:杨杨;余乾;刘昱成;杨华;赵卓;王立民;周平;杨庆勇;代蓉
关键词:绵羊;MYL;基因家族;生物信息学分析;基因表达
-
绵羊骨形态发生蛋白受体-1B基因研究进展
作者:杨初蕾;李星瑶;张译元;唐红;郭延华;王立民;周平
关键词:骨形态发生蛋白受体-1B(BMPR-1B);FecB;绵羊
-
不同茭白品种福寿螺卵块分布及竹片诱螺产卵效果
作者:周平;陈建明;张珏锋;钟海英;李芳;姚金海
关键词:福寿螺;茭白品种;竹片;卵块分布;诱集产卵效果
-
第三师夏河林场绵羊新类群的形成、发展存在的问题及对策研究
作者:杨鹏;郑朝锋;贾春英;邢佳娟;任宇斓;谌春湘;王立民;徐梦思
关键词:夏河绵羊;品种改良;定向选育
-
桃镁离子转运蛋白MGT基因家族鉴定与表达分析
作者:周平;颜少宾;郭瑞;金光
关键词:桃;镁;镁离子转运蛋白;基因表达;功能分化
-
普通烟草VQ家族基因的鉴定及表达
作者:王东;李志远;周平;蒲文宣;毛辉;王雪云;张新要;刘万峰;陈前锋;李晓旭
关键词:烟草;VQ家族;生物逆境胁迫;非生物逆境胁迫