基于基因组SNP信息分析新疆夏洛莱牛群体的遗传结构和遗传背景初报

文献类型： 中文期刊

第一作者： 蒋烈戈

作者： 蒋烈戈;彭健;代蓉;高攀;苏政;刘鹏;朱婷婷;钟发钢;赵博;蔡国宝

作者机构：

关键词： 新疆夏洛莱;基因组SNP信息;遗传多样性;遗传结构;近交系数

期刊名称： 草食家畜

ISSN： 1003-6377

年卷期： 2023 年 001 期

页码： 9-15

摘要： 近50年来，引入的夏洛莱牛在塔额盆地已初步形成遗传性能稳定、产肉性能好的新类群。然而，在夏洛莱牛的杂交改良和选育过程中，缺乏系统的育种档案资料，存在着群体遗传背景不清、血缘关系不明等问题。本研究利用基因组高通量检测技术，分析新疆夏洛莱杂交新类群核心群中的全基因组水平SNPs变化，样本SNP数据平均检出率（Call Rate值）大于90%（99.40%），检测后分析群体中有效群体含量（Ne）、群体的多态性标记比例（Pn），群体的期望杂合度（He）和观察杂合度（Ho）等数据，得出现有新疆夏洛莱核心群体的纯度较好，有效群体含量为28.69，个体间的亲缘关系呈中等程度、整个群体分为26个家系，个体基于ROH的近交系数值是0.030。结论：基因组分析运用高通量测序，通过关联分析，对新疆夏洛莱肉牛群体明确系谱信息，开展全基因组选育，指导组建核心育种群，为群体的遗传背景和血缘关系提供科学依据，对提高今后新疆夏洛莱群体选种的正确性,缩短世代间隔,建立现代新型良种繁育体系有重要的意义。

分类号： S823.2

  • 相关文献

[1]基于SNP芯片分析瑶鸡2个群体亲缘关系. 束婧婷,屠云洁,唐燕飞,刘一帆,蒋华连,巨晓军,章明,单艳菊,姬改革,邹剑敏. 2021

[2]大麦SSR标记遗传多样性及群体遗传结构分析. 王晋,王世红,赖勇,孟亚雄,李葆春,马小乐,尚勋武,王化俊. 2014

[3]四川野生斑茅居群遗传结构的SRAP分析. 张瑜,鄢家俊,白史且,彭燕,梁绪振,张建波,张劲,胡超. 2015

[4]仿刺参微卫星标记的筛选及群体遗传结构分析. 潘传燕,臧云鹏,廖梅杰,王印庚,荣小军,张正,李彬,陈贵平. 2012

[5]利用微卫星PCR分析普安乌骨鸡的遗传结构. 唐继高,朱丽莉,李洪曙,王清颖,韩雁雁. 2015

[6]利用线粒体序列分析黑龙江和松花江流域乌苏里拟鲿种群遗传结构. 吴静,张研,霍堂斌,孙效文. 2013

[7]增殖放流对日本囊对虾群体遗传多样性的影响评估. 魏鸿擎,张凤英,蒋科技,姜亚洲,孟永永,宋炜,马春艳,程家骅,马凌波. 2016

[8]长蛸Octopus variabilis自然群体生化遗传学研究. 高强,郑小东,孔令锋,王昭萍,王如才. 2009

[9]陕西省异色瓢虫种群遗传结构及其多样性. 张小飞,徐玲玲,刘津,白明皓,王振营. 2018

[10]河流型水牛尼里-拉菲和摩拉水牛群体遗传结构分析. 徐文文,孙甜甜,覃广胜,贾银海,王国利,刘瑞鑫,杨秀荣,蒋和生. 2019

[11]瓦氏雅罗鱼达里湖群体和乌苏里江群体的遗传多样性和遗传结构分析. 池炳杰,常玉梅,闫学春,曹顶臣,高玉奎,柳玉海,李勇,梁利群. 2010

[12]北京油鸡群体世代间遗传结构分析. 杨宇泽,张剑,路永强,张权. 2020

[13]基于线粒体控制区序列的花斑蛇鲻遗传多态性分析. 李敏,孔啸兰,许友伟,陈作志. 2020

[14]基于SSR标记的中亚生态区核桃(Juglans regia L.)遗传多样性与种群结构分析. 马凯,赵钰,张恒,韩立群,赵国庆,王继勋. 2021

[15]3个尖塘鳢引进群体繁育后代的遗传多样性分析. 林明辉,朱华平,苏换换,樊佳佳,池金泉,马冬梅. 2021

[16]基于微卫星标记的不同种质资源罗氏沼虾遗传多样性研究. 许珊华,章嘉淇,卢婷,符圆,唐潇,唐琼英,夏正龙,蔡缪荧,高权新,李景芬,杨国梁. 2021

[17]贵州栽培稻的遗传结构及其遗传多样性. 张冬玲,张洪亮,魏兴华,齐永文,王美兴,孙俊立,丁立,汤圣祥,裘宗恩,曹永生,王象坤,李自超. 2006

[18]基于COI序列的长江中上游鲢6个地理群体遗传多样性分析. 沙航,罗相忠,李忠,邹桂伟,梁宏伟. 2018

[19]利用荧光SSR分析中国糜子遗传多样性. 王瑞云,季煦,陆平,刘敏轩,许月,王纶,王海岗,乔治军. 2017

[20]基于EST-SSR的广东与广西茶树资源遗传结构和遗传分化比较分析. 乔小燕,乔婷婷,周炎花,金基强,马春雷,姚明哲,陈亮. 2011

作者其他论文 更多>>

微信小程序