甘薯查尔酮异构酶基因IbCHI的克隆和表达特性

文献类型： 中文期刊

第一作者： 饶莉萍

作者： 饶莉萍;苏文瑾;刘意;宋天晓;SOVIGUIDI Deka Reine Judess;张文英;杨新笋

作者机构：

关键词： 甘薯;IbCHI基因;qRT-PCR;亚细胞定位;表达特性;非生物胁迫

期刊名称： 植物资源与环境学报

ISSN： 1674-7895

年卷期： 2020 年 29 卷 006 期

页码： 1-10

收录情况： 北大核心 ; CSCD

摘要： 根据甘薯〔Ipomoea batatas(Linn.)Lam.〕转录组数据,从甘薯品种'福菜薯7-6'('Fucaishu 7-6')中克隆获得1个编码查尔酮异构酶的基因,命名为IbCHI;IbCHI基因全长732 bp,GC含量为55.19%,共编码243个氨基酸.生物信息学分析结果表明:在IbCHI基因编码的氨基酸序列第12至第214位包含1个Chalcone结构域;IbCHI蛋白分子式为C1156 H1831 N291 O351 S7,理论相对分子质量为25646.41,理论等电点为pI 5.25,并可能具有1个跨膜螺旋区,定位于细胞核和细胞膜上;其氨基酸序列中包含24个带正电荷和27个带负电荷的氨基酸残基,丙氨酸、丝氨酸、缬氨酸和甘氨酸所占比例较高,半胱氨酸所占比例最低;IbCHI蛋白的不稳定指数和总亲水性平均系数分别为38.49和0.074,表明IbCHI蛋白是一种稳定的亲水性蛋白质;IbCHI蛋白二级结构中,α螺旋、随机卷曲、延伸链和β转角所占比例分别为39.51%、31.69%、20.16%和8.64%.多重比对结果显示:IbCHI基因与同属种类圆叶牵牛(I.purpurea Lam.)和牵牛〔I.nil(Linn.)Roth〕CHI基因编码的氨基酸序列高度相似(相似度90%以上),且在系统发育树上聚为同一支.IbCHI基因启动子区包含启动子基本元件TATA-box和CAAT-box,以及胁迫响应元件、茉莉酸甲酯响应元件和光响应元件等26个顺式作用元件.qRT-PCR分析结果表明:IbCHI基因在供试4个甘薯品种'EC15'、'EC16'、'福菜薯18'('Fucaishu 18')和'福菜薯7-6'的根、茎、茎尖和叶中均有表达,但其在不同品种和器官间的相对表达量存在明显差异,其中,'福菜薯7-6'茎和叶中IbCHI基因的相对表达量显著高于其他3个品种.经干旱(质量体积分数30%PEG6000)和盐(0.2 mol·L-1 NaCl)处理后,IbCHI基因的相对表达量随处理时间的延长均呈先下降后上升的趋势,并在处理24 h后该基因的相对表达量显著(P<0.05)升高.综合分析结果表明:甘薯IbCHI蛋白属于Chalcone超级家族,具有较高的保守性;IbCHI基因的表达具有组织和品种特异性,且在调控甘薯对非生物胁迫的响应过程中起重要作用.

分类号： Q943.2%S531

  • 相关文献

[1]小麦热激转录因子基因TaHsfA2e特性及耐热性功能初探. 张玉杰,张园园,张华宁,秦宁,李国良,郭秀林. 2018

[2]水稻OsWRKY7基因的表达研究. 李茹,周洁,李冬月,王栩鸣,杨勇,余初浪,程晔,严成其,陈剑平. 2015

[3]小麦热激转录因子基因TaHsfA2e特性及耐热性功能初探. 张玉杰,张园园,张华宁,秦宁,李国良,郭秀林. 2018

[4]岷江百合蛋白激酶基因lilyABC1的克隆及在非生物胁迫下的表达特性分析. 袁迎迎,梁云,袁素霞,徐雷锋,李雅男,Younes Pourbeyrami Hir,刘春,明军. 2014

[5]小麦蛋白磷酸酶2A调节亚基基因TaBβ-1的克隆及其在非生物胁迫下的表达特性. 刘诗航,王彩香,毛新国,刘惠民,李昂,景蕊莲. 2010

[6]陆地棉耐碱基因GHZAT12的克隆、表达及生物信息学分析. 范亚朋,范亚朋,芮存,张悦新,陈修贵,陆许可,王帅,张红,徐楠,王晶,陈超,叶武威. 2021

[7]番茄转录因子基因SlWRKY6的克隆与原核表达分析. 周涛,王娟,胡佳蕙,王柏柯,李宁,余庆辉. 2020

[8]番茄转录因子基因SlWRKY16的克隆及原核表达分析. 周涛,王娟,王露露,王柏柯,胡佳蕙,兰海燕,余庆辉. 2020

[9]香蕉NHX基因家族的鉴定及表达分析. 徐亚,滕梦鑫,何岳东,乔飞,李新国. 2021

[10]非生物胁迫下耐辐射异常球菌drB0118基因功能分析. 刘盈盈,张陈,江世杰,周正富,陈明,张维,王劲. 2015

[11]普通小麦TaSEC14p-5基因的克隆及表达分析. 苏世超,唐益苗,徐磊,王伟伟,高世庆,马锦绣,孙辉,王永波,乔亚科. 2016

[12]过表达玉米转录因子ZmWRKY101基因提高拟南芥植株的耐盐力. 郭玉敏,张云华,井涛,臧小平. 2020

[13]高羊茅FaGST1基因克隆、亚细胞定位及表达分析. 陈锡,赵德刚,陈莹,吴佳海,袁暘暘,王小利. 2020

[14]玉米ZmPP2C6-01基因的克隆及表达分析. 袁珍,张鹏钰,王国瑞,曹丽茹,库丽霞,卫丽. 2019

[15]紫花苜蓿MsWRKY42的分离、鉴定及其对非生物胁迫的响应. 刘佼佼,王学敏,马琳,崔苗苗,曹晓宇,赵威. 2020

[16]大豆MYB转录因子基因GmMYB174的克隆及分子特性分析. 魏麦玲,裴丽丽,刘佳明,闵东红,陈明,李连城,马有志,徐兆师,张小红. 2014

[17]大豆MYB转录因子基因GmMYB174的克隆及分子特性分析. 魏麦玲,裴丽丽,刘佳明,闵东红,陈明,李连城,马有志,徐兆师,张小红. 2015

[18]水稻TAF12b基因cDNA克隆及其分子特性鉴定. 齐盼盼,郭留明,李静,吕明芳,袁正杰,张恒木. 2023

[19]小麦TaHPPR基因的克隆与表达分析. 郝小聪,王伟伟,张风廷,孙瑞,房兆峰,柳珊,曹志琛,朱文根,赵昌平,汪德州,唐益苗. 2021

[20]大豆RNA依赖的RNA聚合酶基因GmRDR1的克隆与表达特性分析. 吴冰月,沈良,宋普文,陈华涛,崔瑾,许晓明,陈新. 2015

作者其他论文 更多>>

微信小程序