杧果TRAP标记反应体系的优化与引物筛选

文献类型： 中文期刊

第一作者： 罗纯

作者： 罗纯;武红霞;姚全胜;王松标;许文天;马小卫

作者机构：

关键词： 杧果;TRAP;体系优化;引物筛选

期刊名称： 中国南方果树

ISSN： 1007-1431

年卷期： 2015 年 44 卷 04 期

页码： 5-10

收录情况： 北大核心

摘要： 为了建立杧果目标区域扩增多态性(TRAP)标记技术体系,对影响该反应体系的Mg2+、dNTPs、固定引物浓度、随机引物浓度以及Taq DNA聚合酶等5个因素进行优化。确定优化的反应体系总体积为15μL,包括模板DNA 40ng、1×buffer、Mg2+1.4mmol/L、dNTPs 0.2mmol/L、固定引物0.8μmol/L、随机引物0.04μmol/L、Taq酶1.7U。利用杧果公共数据库抗病基因相关序列设计锚定引物13条,与7条随机引物组合共91对引物。利用这些引物对杧果品种进行TRAP-PCR扩增,其中66个引物组合能扩增出清晰条带,且表现出良好的多态性,占引物总量的72.53%。

分类号： S667.7

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