一株Lineage7和Lineage8重组PRRSV的全基因组分析

文献类型： 中文期刊

第一作者： 许浒

作者： 许浒;李金昊;张思钰;孙琪;张梦琳;郭镇洋;龚帮俊;李超;相丽润;彭金美;王倩;周国辉;汤艳东;冷超粮;赵款;安同庆;蔡雪辉;张洪亮;田志军

作者机构：

关键词： Lineage7 PRRSV;Lineage8 PRRSV;重组病毒;首次发现

期刊名称： 中国预防兽医学报

ISSN： 1008-0589

年卷期： 2025 年 47 卷 007 期

页码： 745-750

收录情况： 北大核心 ; CSCD

摘要： Lineage7 PRRSV最早出现于美国，2005年Lineage7 PRRSV在我国首次发现，但近20年一直无该分支PRRSV的报道。2024年黑龙江省某猪场疑似出现PRRS疫情，保育猪出现咳嗽、消瘦等临床症状。为明确引起猪发病的病原，本研究采集14份保育猪血清，经荧光定量RT-PCR(RT-qPCR)鉴定并测序分析。结果显示其中2份为PRRSV-2阳性，测序结果显示，2份阳性血清样品中PRRSV-2的基因序列一致，且于同一猪场发生，表明两株PRRSV-2相同，将其命名为HLJ3897株。利用高通量测序技术对HLJ3897株全基因组测序，利用Megalign软件分析HLJ3897株与各谱系PRRSV-2代表株全基因组序列的相似性；利用MEGA7.0软件构建PRRSV ORF5基因、部分Nsp2基因和全基因组序列的遗传进化树，分析其遗传变异情况；利用Simplot3.5.1和RDP4软件分析HLJ3897株的重组事件；利用Megalign软件比对各谱系PRRSV Nsp2的氨基酸序列，分析其氨基酸序列的变异。结果显示测序获得的HLJ3897株全基因组序列长15 409 bp，全基因组序列相似性比对结果显示，HLJ3897株与Lineage 8 HP-PRRSV代表株JXA1的相似性最高达96.5%，与其他谱系PRRSV代表株的相似性为83.6%～93.3%。ORF5基因和全基因组序列的遗传进化树结果显示，HLJ3897株与Lineage8的HP-PRRSV处于同一进化分支，为Lineage8 PRRSV，与相似性分析结果一致，而基于部分Nsp2基因的遗传进化树显示HLJ3897株与Lineage7 PRRSV处于同一进化分支，这表明我国HP-PRRSV出现了新的变异。重组分析结果显示，HLJ3897株是以HP-PRRSV JXA1株为主要亲本，Lineage7 PRRSV APRRS株提供部分Nsp2基因片段的重组病毒，重组断点分别位于nt1 507和nt3 205。根据重组断点前（nt1～nt1 507）、中（nt1 508～nt3 205）、后（nt3 206～nt15 409）3个片段构建的遗传进化树验证了上述重组分析的结果。氨基酸比对结果显示，HLJ3897株Nsp2氨基酸序列均未出现Lineage7 PRRSV和HP-PRRSV的特征性氨基酸序列的插入或缺失。本研究在中国首次发现并报道了Lineage7 PRRSV与Lineage8 HP-PRRSV的重组野毒株，提示我国PRRSV-2的流行日趋复杂，应加大监测力度，关注PRRSV-2变异株对我国养猪业的危害。本研究对了解我国PRRSV-2的流行现状以及PRRS的防控均具有重要指导意义。

分类号： S852.651

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