梭梭VHA-B基因克隆及序列分析

文献类型: 中文期刊

第一作者: 杨丽丽

作者: 杨丽丽;吴明朝;甘晓燕;石磊;陈虞超;宋玉霞

作者机构:

关键词: 梭梭;抗逆;VHA-B;序列分析

期刊名称: 西北农业学报

ISSN: 1004-1389

年卷期: 2013 年 22 卷 10 期

页码: 68-74

收录情况: 北大核心 ; CSCD

摘要: 采用RT-PCR和RACE法从超旱生、耐盐植物梭梭(Haloxylon ammodendron)中扩增出VHA-B基因cDNA序列,其开放阅读框为1 413bp,推测编码全长为471个氨基酸残基的氨基酸序列,该蛋白分子量约为52.304ku,等电点为5.08。运用SMART、DNAMAN、GOR4、TMPred等生物信息学软件对梭梭VHA-B功能域、跨膜结构进行分析显示,梭梭VHA-B含有3个ATP-synt_ab_N、ATP-synt_ab、ATP-synt_ab_C结构域,但是不含跨膜结构域和信号肽。氨基酸序列同源性结果显示,HaVHA-B与盐爪爪、盐穗木、碱蓬等同源性高达89.68%。说明VHA-B基因是一个高度保守基因。

分类号: S793.9

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