三月李及其红肉突变体Aux/IAA家族基因鉴定及分析
文献类型: 中文期刊
第一作者: 方智振
作者: 方智振;姜翠翠;周丹蓉;潘少霖;叶新福
作者机构:
关键词: 李;转录组;Aux/IAA家族;生物信息学分析;表达分析
期刊名称: 核农学报
ISSN: 1000-8551
年卷期: 2020 年 02 期
页码: 247-255
收录情况: 北大核心 ; CSCD
摘要: 为了解Aux/IAA家族基因在李果实成熟过程中的生物学功能,通过生物信息学鉴定三月李及其红肉突变体果实转录组中的Aux/IAA家族基因,并分析其在果实成熟过程中的表达模式。结果表明,三月李及其红肉突变体果实转录组中共有26个Aux/IAA家族成员,大部分为位于细胞核的不稳定亲水蛋白质。系统进化树分析表明,Aux/IAA家族成员可分为A、B两组,共9个亚组。大部分Aux/IAA蛋白质含有4个高度保守的结构域。16个Aux/IAA家族基因在三月李及其红肉突变体果实成熟过程中差异表达。PsIAA11、PsIAA13、PsIAA14、PsIAA18、PsIAA19和PsIAA25在三月李及其红肉突变体果实成熟过程中的表达模式存在显著差异。上述结果表明,Aux/IAA家族基因与李果实成熟密切相关,这为深入研究Aux/IAA家族基因在李果实成熟过程中的功能奠定了基础。
分类号: S662.3
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