PseudomonasstutzeriA1501基因组结构及功能注释

文献类型： 中文期刊

第一作者： 燕永亮

作者： 燕永亮;杨剑;窦岳坦;平淑珍;王忆平;金奇;林敏

作者机构：

关键词： 基因组测序;斯氏假单胞菌A1501;联合固氮;比较基因组学

期刊名称： 中国农业科技导报

ISSN：

年卷期： 2008 年 05 期

页码： 45-52

收录情况： CSCD

摘要： 采用全基因组"shotgun"方法完成了固氮斯氏假单胞菌A1501的全基因组序列测定,并进行了基因组结构与功能注释分析。A1501基因组全长4567418bp,含有4146个ORFs。该基因组中已鉴定了42个编码转座酶的重复序列,这些序列的存在预示着转座现象在A1501菌中非常活跃,预示该菌与其他生物之间基因交流可能比较频繁。比较基因组表明,为了适应特定的生存环境,假单胞菌在基因组结构和遗传信息容量上产生了明显的分化。此外,基因组分析鉴定了A1501环境适应的遗传基础,包括物质转运、信号传导和趋化系统等,这些系统是细菌能够在根际土壤环境中保持竞争力以及能够与水稻形成高效联合固氮体系的关...

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