湖羊PLAG1基因5′调控区多态性及其与早期体重的关联分析

文献类型： 中文期刊

第一作者： 郭潇潇

作者： 郭潇潇;李隐侠;王悦;张含;张俊;钱勇;孟春花;王慧利;仲跻峰;曹少先

作者机构：

关键词： 湖羊;PLAG1基因;5′调控区;SNPs;初生体重;断奶体重

期刊名称： 畜牧兽医学报

ISSN：

年卷期： 2021 年 002 期

页码： 331-343

收录情况： 北大核心 ; CSCD

摘要： 旨在克隆湖羊PLAG1基因5′调控区序列,明确PLAG1基因5′调控区多态性与湖羊早期体重的关系,寻找用于湖羊生长性状辅助选择的分子标记。本研究利用5′RACE技术鉴定PLAG1基因转录起始位点,以456只断奶湖羊为对象,利用测序法筛选PLAG1 5′调控区SNP位点,使用SPSS 18.0软件分析不同基因型对湖羊初生体重和断奶体重的影响。结果表明,PLAG1基因转录起始位点均位于g.30535位点,测序发现,PLAG1基因5′调控序列存在15个SNPs位点,在湖羊群体中均有3种基因型,均处于Hardy-Weinberg平衡状态。关联分析发现,g.28888A>T位点AA型、g.28901G>T位点GG型、g.30802C>T位点CC型、g.30825A>G位点AA型的初生体重均显著大于相应的杂合基因型（P<0.05）,g.30737T>C位点CC型断奶体重显著小于TC型（P<0.05）。连锁分析发现,g.28888A>T、g.28901G>T、g.28913T>A、g.29717G>C、g.29724A>C、g.29725G>A、g.29768T>C、g.29771A>G、g.30141T>A、g.30144A>G、g.30691C>A、g.30694A>T、g.30737T>C、g.30802C>T、g.30825A>G, 15个位点连锁且有18种单倍型。将样本量较多的5种单倍型与湖羊早期体重进行关联分析发现,AAGGTAGGAAGGTTAATTAACCAATCCCAA单倍型初生体重显著大于ATGTTAGCACGATCAGTAAGCAATTCCTAG单倍型（P<0.05）,断奶体重显著大于AAGGAAGGAAGGTTAATTAACCAACCCCAA单倍型（P<0.05）。上述结果表明,湖羊群体中PLAG1基因5′调控区存在15个连锁的SNPs位点,其中g.28888A>T、g.28901G>T、g.30802C>T、g.30825A>G位点与初生体重显著相关（P<0.05）,g.30737T>C位点与断奶体重显著相关（P<0.05）,AAGGTAGGAAGGTTAATTAACCAATCCCAA单倍型与初生体重和断奶体重显著相关（P<0.05）,说明PLAG1基因可作为湖羊生长性状选择的候选遗传标记。

分类号： S826

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