茶树多酚氧化酶基因的SNP分析

文献类型： 中文期刊

第一作者： 黄建安

作者： 黄建安;黄意欢;罗军武;李家贤;龚志华;刘仲华

作者机构：

关键词： 茶树;多酚氧化酶基因;单核苷酸多态性

期刊名称： 湖南农业大学学报(自然科学版)

ISSN： 1007-1032

年卷期： 2007 年 33 卷 04 期

页码： 454-458+485

收录情况： 北大核心 ; CSCD

摘要： 选取有代表性的40个茶树品种(系)为材料,先采用PCR-SSCP-银染检测技术,对供试材料的多酚氧化酶(PPO)基因进行SSCP分析,对PPO基因作初步基因分型;根据分型分析结果,对每一类型选择典型品种的PPO基因作进一步的DNA序列分析,用DNASTAR Program进行单核苷酸多态性(SNP)搜寻.结果表明,茶树PPO基因存在丰富的SNP,其类型包括:转换(AG,CT)、颠换(AT,GC,G→T,A→C)与杂合子(C/T,A/G,G/T,A/T,A/C,G/C).在发现的37个SNPs中,有13个SNPs发生在核酸内切酶酶切位点,有10个错义SNPs位点导致氨基酸的改变.在PPO基因的保守序列区,出现SNP的频率较低.

分类号： S571.1

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