野生种花生GLP家族基因的鉴定与特征分析
文献类型: 中文期刊
第一作者: 刘汝莹
作者: 刘汝莹;王冕;韩守萍;陈娜;潘丽娟;陈明娜;许静;迟晓元;王通
作者机构:
关键词: 花生;类萌发素;基因组;表达
期刊名称: 花生学报
ISSN: 1002-4093
年卷期: 2020 年 49 卷 002 期
页码: 28-35
摘要: GLP是一类普遍存在于植物界的cupin超家族基因,在调控植物生长发育和抗逆反应中起到多种重要作用.本研究从全基因组水平研究野生种花生GLP基因家族,共鉴定出38个GLP基因.结构域分析显示,绝大多数花生GLP都含有保守的cupin保守结构;基因结构和系统发育分析表明38个花生GLP家族基因分成Subfamily I、Subfamily II和Gymosperm subfamily 3个亚家族,分别有20个、10个和8个成员,其中Subfamily I内含子/外显子结构较一致,无显著差异;Gymosperm sub-family中GLP基因内含子长度差异最大,最长达6.3 kb;Subfamily II中的基因内含子数量差异最显著,最多达5个.说明基因结构与系统进化有一定的关系.染色体定位分析显示,花生GLP基因在花生17条染色体中的分布呈不均匀性,存在5个基因簇,其中染色体A06上分布最多,为9个;其次是B06,分布6个.基因表达分析显示,在22个不同的组织中,仅有8个野生种花生GLP家族基因呈现出差异表达,其中6个属于Subfamily II,且表达总量显著高于其他基因,而Subfamily I成员均未检测到表达.该结果将为今后花生GLP家族基因的功能研究与利用提供参考.
分类号: Q943.2%S565.2
- 相关文献
[1]花生基因组资源的开发及应用. 陈小平,梁炫强. 2012
[2]花生球蛋白基因克隆及其表达分析. 全先庆,杨辉霞,单雷,毕玉平. 2006
[3]兔病毒性出血症病毒基因组结构与功能研究进展. 刘光清,云涛,倪征,张玉颖. 2006
[4]西瓜基因组框架图绘制与果实品质基因挖掘. 张海英,林魁,张明方,张建国,张永兵. 2016
[5]CTAB法提取火龙果基因组DNA的试验研究. 韦茜,蔡永强,金吉芬,陶刚,朱英. 2008
[6]利用高通量测序分析侵染贵州火龙果的病毒. 郑乾明,王壮,彭志军,马玉华,蔡永强. 2017
[7]香蕉Ran家族基因的全基因组分析. 张雅玲,方智振,赖钟雄. 2015
[8]3株鸭肝炎病毒1型全基因序列分析. 杨维星,施少华,陈红梅,万春和,程龙飞,傅光华,林芳,林建生,苏敬良,黄瑜. 2010
[9]国际花生黄曲霉和基因组研讨会将在广东召开. 周桂元. 2006
[10]牛病毒性腹泻-黏膜病核酸疫苗的研究现状. 姜玲玲,周思旋,徐洪忠. 2015
[11]鸭圆环病毒基因组序列分析及其C1截短基因的原核表达. 施少华,陈珍,杨维星,傅光华,程龙飞,陈红梅,彭春香,黄瑜. 2009
[12]糙皮侧耳遗传学研究进展. 徐荣荣,图力古尔. 2014
[13]猪繁殖与呼吸综合征病毒Shanxi-6株全基因序列分析. 韩一超,刘文俊,姚敬明,吴忻,王娟萍,武守艳,陈剑波,孟帆,郭慧慧,杨丽华,雷宇平,樊振华. 2014
[14]八种植物线粒体基因组结构特征分析与比较. 李玉秋,赵洪锟,谭化,刘晓东,张春宝,董英山. 2011
[15]芦笋基因组DNA提取与ISSR反应体系的优化. 盛文涛,周劲松,汤泳萍,罗绍春,朱友林,陈光宇. 2010
[16]金黄色葡萄球菌特异性PCR检测靶点的自动化筛选. 范一灵,朱东升,胡瑜,史贤明. 2011
[17]基因组细菌人工染色体文库(BAC)的构建及应用. 李海权,刁现民. 2005
[18]新城疫病毒非编码序列的遗传演化趋势. 徐怀英,秦卓明,亓丽红,张伟,王友令,刘金华. 2014
[19]新型鸭肝炎病毒分离株JFX08全基因组测定与分析. 赵立娜,马秀丽,李玉峰,黄兵,宋敏训,李建亮,崔言顺. 2010
[20]鸡传染性贫血病毒分子生物学研究进展. 鄢明华,刘长军,王英珍,李秀丽. 2002
作者其他论文 更多>>
-
3个优质甜玉米品种幼苗及田间耐寒性分析
作者:詹鹏麟;张扬;林建新;卢和顶;许静;庄炜;陈山虎;廖长见
关键词:甜玉米;苗期;耐寒性;生理指标;出籽率
-
生物菌肥FBR1不同施用方式对花生生长发育及产量的影响
作者:彭守华;许铭铭;尉继强;梁丽君;叶全;迟晓元;张少峰;董向丽
关键词:FBR1菌株;生物菌肥;花生;生长发育;产量
-
氯霉素和土霉素可视化适配体检测试纸研究与制备
作者:王红旗;郑嘉;刘继红;王俊艳;曹成;尹海燕;刘雪平;王冕
关键词:适配体传感器;可视化检测;检测试纸;抗生素;土霉素;氯霉素
-
发芽对不同品种糙米γ-氨基丁酸及酚类物质累积的调控作用
作者:汪昱柯;王冕;王晓晴;宋世钰;谢翀;蔡敬敬;胡标林;杨润强
关键词:糙米;发芽;酚类物质;γ-氨基丁酸
-
不同花生品种烤仁加工特性分析
作者:赵健鑫;殷祥贞;姜骁;陈娜;赵旭红;王明清;宋虎成;钟文;梁成伟;迟晓元
关键词:加工特性;感官评价;风味物质;氧化稳定性
-
花生品质与气候环境的关系研究
作者:梁煜莹;张加羽;姜骁;王露欢;张晓吉;刘齐妹;薛云云;迟晓元;白冬梅
关键词:花生;品质;环境;相关性;影响
-
优质甜玉米骨干系在低温下种子萌发及幼苗抗性研究
作者:廖长见;詹鹏麟;张扬;卢和顶;许静;庄炜;陈山虎;林建新
关键词:甜玉米;低温胁迫;发芽率;耐寒性;育种