核盘菌和灰葡萄孢基因组中的简单重复序列分析

文献类型： 中文期刊

第一作者： 李伟

作者： 李伟;陈怀谷;李伟;张爱香;陈丽华;姜伟丽

作者机构：

关键词： 核盘菌;灰葡萄孢;简单重复序列;群体遗传学

期刊名称： 遗传

ISSN： 0253-9772

年卷期： 2007 年 29 卷 09 期

页码： 1154-1160

收录情况： 北大核心 ; CSCD

摘要： 利用公共的真菌基因组数据库资源,对核盘菌(Sclerotinia sclerotiorum)和灰葡萄孢(Botrytis cinerea)基因组中SSRs的结构类型、分布、丰度及最长序列等进行了系统分析,并与已经研究过的禾谷镰孢菌(Fusarium graminearum),稻瘟病菌(Magnaporthe grisea)和黑粉菌(Ustilago maydis)等几种植物病原真菌基因组中的SSRs进行了比较。结果表明:核盘菌和灰葡萄孢基因组中的SSRs非常丰富,分别为6539和8627个,并且在结构类型和分布规律上具有一定的相似性;与其他几种病原真菌相比,核盘菌和灰葡萄孢基因组中长重复的四、五、六核苷酸基序更为丰富,从而使得这两种真菌具有更高的变异性。同时,我们发现真菌基因组中SSRs的丰度与基因组的大小及GC含量没有必然的关系。文章对核盘菌和灰葡萄孢基因组中SSRs的丰度、出现频率及最长基序的分析为快速、便捷地设计多态性丰富的SSRs引物提供了有益的信息。

分类号： S432.4

  • 相关文献

[1]基因频率随机过程模型的形成与发展. 张立岭,钱宏光. 2000

[2]分子生态学与生物信息学. 李媛,崔尚金,李建伟,于康震. 2002

[3]禾谷丝核菌基因组SSR标记的开发及评价. 李伟,张兴,孙海燕,邓渊钰,张爱香,马东方,陈怀谷. 2017

[4]浅析畜禽活体保种的影响因素. 阎景娟,马月辉,道尔吉. 2003

[5]新疆栽培杏群体遗传结构的SSR分析. 何天明,陈学森,高疆生,张大海,徐麟,吴燕. 2006

[6]青海省东部地区小麦条锈菌群体遗传结构分析. 周聪颖,吕璇,邓杰,赵宝强,高图强,姚强,马占鸿. 2023

[7]梨形环棱螺6个地理种群遗传多样性与遗传分化分析. 李珂,马学艳,杨轲,陈琬雯,金武,闻海波. 2024

[8]5个宽体金线蛭种群遗传多样性和遗传分化的SNP分析. 高凯利,马学艳,王海华,李涵,李燕华,金武,闻海波. 2024

[9]拟南芥AtBT4对灰葡萄孢的抗性机制分析. 郝丛丛,杨萍,陈展,贾娇,赵斌,司贺龙,韩建民,邢继红,董金皋. 2013

[10]天然化合物丁香酚对灰葡萄孢菌丝脂质过氧化和膜损伤的影响. 王春梅,张杰,陈浩,石志琦,范永坚. 2009

[11]陕西省烟草灰霉病病原及云芝多糖对其防治研究. 李金岭,罗晶,单宏英,成巨龙,陈德鑫,安德荣. 2013

[12]铁皮石斛灰霉病病原分离鉴定及防治. 游景茂,郭杰,李哲,杨琴,段媛媛,郭晓亮,黄大野,邹庄玲,郭汉玖. 2019

[13]草莓灰霉病菌对啶酰菌胺抗性及其SdhB基因序列差异的分子检测. 刘欣,曾蓉,徐丽慧,高士刚,戴富明. 2019

[14]长三角地区设施作物上灰霉病菌的群体遗传结构分析. 李伟,卢晓雪,张爱香,周鑫,魏利辉,陈怀谷. 2018

[15]5种杀菌剂对广西葡萄灰霉病病菌的毒力评价. 宋雅琴,娄兵海,陈爱军,白先进,刘萍,王博,张瑛,何建军,李善菊. 2017

[16]黑龙江省番茄灰霉病病原菌的分离与鉴定. 田志革,李文枫,陈立新,毕洪文,黄峰华,吴立成. 2018

[17]6种杀菌剂对蓝莓采后灰葡萄孢菌的室内毒力测定. 戴启东,李广旭,杨华,张广仁,周朝辉. 2019

[18]拟康宁木霉T-51菌株发酵液对灰葡萄孢的抑菌活性. 尤佳琪,李国庆. 2021

[19]五种琥珀酸脱氢酶抑制剂类杀菌剂与灰葡萄孢琥珀酸脱氢酶的结合模式及抗性机制分析. 陶丽红,李佳俊,夏美荣,李康,范黎明,苏发武,吴文伟,王凯博,叶敏. 2021

[20]华重楼灰霉病菌灰葡萄孢ITS分型及SSR遗传多样性分析. 王帆帆,唐涛,曾佳,郭杰,唐其,郭晓亮,段媛媛,游景茂. 2021

作者其他论文 更多>>

微信小程序