南瓜HSP70蛋白家族的鉴定和生物信息学分析
文献类型: 中文期刊
第一作者: 胡艳平
作者: 胡艳平;周扬;云天海;朱白婢;王敏;张文
作者机构:
关键词: 南瓜;热激蛋白70;生物信息学;启动子分析
期刊名称: 北方园艺
ISSN: 1001-0009
年卷期: 2019 年 017 期
页码: 7-13
收录情况: 北大核心
摘要: 热激蛋白70(heat shock protein 70,HSP70)是植物应对逆境胁迫产生的一类特定的应激蛋白.以南瓜基因组数据库为基础,利用生物信息学方法对南瓜HSP70基因家族进行鉴定分析,并对蛋白特征、基因结构、保守结构域和启动子序列进行研究.结果 表明:南瓜基因组数据库中含有10个HSP70,编码的蛋白序列长度为572~843个氨基酸,HSP70蛋白含有6~8个保守结构域,可分为4个亚家族.基因结构分析表明HSP70具有0~8个内含子.启动子元件分析显示HSP70的启动子含有多个信号元件,说明HSP70可能参与多种功能的调控.研究结果为下一步研究HSP70家族蛋白的功能奠定基础.
分类号: S642.1
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