竹黄菌Ku70基因全长克隆及序列分析

文献类型： 中文期刊

第一作者： 黄青青

作者： 黄青青;任锡毅;谭玉梅;魏洪美;乙引

作者机构：

关键词： 竹黄菌;Ku70基因;RACE

期刊名称： 基因组学与应用生物学

ISSN： 1674-568X

年卷期： 2015 年 34 卷 12 期

页码： 2593-2600

收录情况： 北大核心 ; CSCD

摘要： 为构建竹黄菌高效敲除载体,以利于竹黄菌基因功能及竹黄菌与寄主竹子之间的相互关系的研究,利用RT-PCR(reverse transcriptase-PCR)及RACE(rapid amplification of c DNA ends)技术克隆获得Ku70基因全长序列,命名为s Ku70。序列分析显示:该序列基因全长为2 306 bp,开放阅读框长度为1 974 bp,编码657个氨基酸,分子质量为73.940 5 k D,理论等电点p I为5.58;序列同源性分析表明:该基因序列和预测的蛋白序列与小麦叶枯病菌SN15(Phaeosphaeria nodorum SN15)的Ku70 m RNA序列(XM_001803174.1)及ATP依赖的DNA解旋酶亚基Ⅱku70(Q0U5F2.1)同源性最高,identity分别75%和78%。二级结构预测表明Ku70蛋白α-螺旋(alpha helix)占36.99%,延伸链(extended strand)占17.05%,无规卷曲(random coil)占36.23%;包含一个Ku-core domain、一个Von Willebrand factor type A(v WA)domain和一个SAP domain,为亲水蛋白;并利用同源模建的方法预测了其三级结构。

分类号： Q78`S567.3

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