淹水胁迫下鸭茅根系基因差异表达及相关通路分析

文献类型： 中文期刊

第一作者： 曾兵

作者： 曾兵;尚盼盼;沈秉娜;王胤晨;屈明好;袁扬;毕磊;杨兴云;李文文;周晓丽;郑玉倩;郭文强;冯彦龙;曾兵

作者机构：

关键词： 鸭茅;淹水胁迫;根系;转录组;差异表达基因;代谢通路

期刊名称： 草业学报

ISSN： 1004-5759

年卷期： 2024 年 33 卷 002 期

页码： 93-111

收录情况： 北大核心 ; CSCD

摘要： 近年来我国南方地区洪涝灾害频繁发生,严重制约草牧业的发展.鸭茅作为重要的生态草种和优质牧草,耐淹性较差的特性严重影响其在频繁遭受洪涝区域的推广应用.本研究以国审品种"安巴"鸭茅为研究对象,对淹水胁迫0、8和24 h处理后的幼苗根系生理和转录等进行分析,以探究鸭茅在淹水胁迫下的响应机制.结果显示,淹水胁迫引起鸭茅根系中可溶性糖、可溶性蛋白和丙二醛含量显著增加,相对电导率先减少后显著升高.在淹水胁迫处理8 h后(相较于0h),鸭茅根系中有5788个差异表达基因,包括上调基因2872个,下调基因2916个.胁迫处理24 h后,鸭茅根系中共有8807个差异表达基因,包括上调基因4123个,下调基因4684个.GO富集显示,这些差异表达基因功能主要涉及多糖代谢、微管结合、纤维素代谢过程、抗氧化反应等.KEGG富集显示,鸭茅根系主要通过苯丙烷生物合成、碳代谢、谷胱甘肽代谢、氨基酸生物合成、淀粉和蔗糖代谢以及糖酵解/糖异生等途径来响应淹水胁迫.进一步分析苯丙烷生物合成、碳代谢、谷胱甘肽代谢通路中的差异表达基因,推测HXK1、HXK2、ADH1、GST和APX2等关键基因在鸭茅响应胁迫中发挥重要作用.MYB、NB-ARC、WRKY、GRAS和AP2等转录因子家族基因在淹水胁迫中表达丰富,可能与鸭茅的耐淹性密切相关.本研究结果为进一步探究鸭茅耐淹的分子机理提供了基础数据,也为后续的鸭茅耐淹性状改良工作提供理论支撑.

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