猪繁殖障碍与呼吸综合征病毒HN-HW株ORF2-7基因的克隆与序列分析

文献类型： 中文期刊

第一作者： 郝雪峰

作者： 郝雪峰;关贵全;李有全;马米玲;刘爱红;马新龙;江丽丽;殷宏;罗建勋

作者机构：

关键词： 猪繁殖障碍与呼吸综合征病毒;HN-HW株;ORF2-7;克隆与序列分析

期刊名称： 华北农学报

ISSN： 1000-7091

年卷期： 2009 年 24 卷 04 期

页码： 36-40

收录情况： 北大核心 ; CSCD

摘要： 为了研制有效的PRRS疫苗,参照GenBank中公布的猪繁殖障碍与呼吸综合征病毒(PRRSV)美洲型ATCCVR-2332基因序列,用Primer 5.0软件分别设计合成了针对PRRSVORF2、ORF3、ORF4、ORF5、ORF6和ORF7基因的特异性引物,利用RT-PCR从HN-HW株分别扩增得到了大小约771,904,564,670,619和586 bp的片段,并将扩增的片段插入pGEM-Teasy载体,然后转化到大肠杆菌JM109感受态细胞中,挑取阳性克隆PCR和酶切鉴定后进行测序。利用DNAStar软件将HN-HW株ORF2-7基因的核苷酸序列和推导氨基酸序列与ATCC VR-2332、JX-A1、CH-1a、BJ-4、HB-1、HB-2、HEB-1、HUB-1、HUB-2、SP、P129、MN184A、RespPRRS MLV、Prime Pac、LV等毒株相应序列进行了同源性分析,并绘制系统进化树。结果显示,HN-HW株与美洲型ATCC VR-2332核苷酸同源性为88.9%~94.9%,与欧洲型LV核苷酸同源性为64.0%~69.0%;推导氨基酸序列与ATCC VR-2332株同源性为82.4%~96.0%,与LV株的同源性为34.5%~78.9%。系统进化树表明,HN-HW株属于美洲型,与JXA1、HUB-1、HUB-2、HEB-1亲缘关系较近。

分类号： S852.65

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