萱草不同器官实时荧光定量PCR内参基因的筛选

文献类型： 中文期刊

第一作者： 梁锦

作者： 梁锦;刘海婷;钟荣;李昊;尹冬梅;刘翔;秦巧平;张志国;段可;倪迪安

作者机构：

关键词： 萱草;不同器官;内参基因;实时荧光定量PCR

期刊名称： 植物生理学报

ISSN： 2095-1108

年卷期： 2020 年 009 期

页码： 1891-1898

收录情况： 北大核心 ; CSCD

摘要： 根据我们之前的萱草(Hemerocallis fulva)转录组测序结果,采用生物信息学方法筛选用于实时荧光定量PCR的候选内参基因,并以萱草的根、茎、幼叶和三个发育阶段的花(长度约4 cm的幼嫩花蕾、长度约7 cm的即将开放的花蕾和开放的花朵)为材料,通过实时荧光定量PCR (qRT-PCR)测定通过转录组分析筛选到的6个候选内参基因(HfADF、HfTUB、HfGAPDH、HfTIP41、HfEF-1α和HfUBQ)在各样品中的表达量.使用统计软件geNorm、NormFinder和BestKeeper对上述6个候选内参基因进行了评估.结果表明:这些候选内参基因在不同样品中的表达量存在明显差异,适用于萱草不同器官研究的最优内参基因为HfTIP41和HfGAPDH.本研究首次评价了萱草内参基因稳定性,为该物种基因表达分析提供参考.

分类号： S682.19

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