实时定量PCR法预测禾谷丝核菌Rhizoctonia cerealis基因组大小

文献类型： 中文期刊

第一作者： 张春燕

作者： 张春燕;李伟;孙海燕;邓渊钰;张爱香

作者机构：

关键词： 禾谷丝核菌;基因组大小;翻译延伸因子A;单拷贝;实时定量PCR

期刊名称： 微生物学通报

ISSN： 0253-2654

年卷期： 2014 年 41 卷 09 期

页码： 1917-1923

收录情况： 北大核心 ; CSCD

摘要： 【目的】准确测定基因组大小是进行禾谷丝核菌Rhizoctonia cerealis全基因组序列测定和拼接的基础,本研究旨在利用实时定量PCR方法预测禾谷丝核菌的基因组大小。【方法】首先克隆了禾谷丝核菌R0301菌株翻译延伸因子A基因(tef A)的部分序列,Southern杂交明确该基因在该病菌基因组中为单拷贝。以已测序立枯丝核菌(Rhizoctonia solani)AG1-IA融合群菌株GD118为对照,采用实时定量PCR的方法进行了禾谷丝核菌基因组大小的预测。【结果】实时定量PCR的方法可以比较准确的测定立枯丝核菌基因组的大小,研究首次预测了禾谷丝核菌的基因组大小位于32.2–36.6 Mb之间。【结论】实时定量PCR法是一种快速和简便的预测丝核菌基因组大小的方法。

分类号： Q78

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