木薯FER基因家族的全基因组鉴定和表达分析
文献类型: 中文期刊
第一作者: 李建君
作者: 李建君;郭鑫;林晨俞;王文娟;高苗苗;陈银华;于晓惠
作者机构:
关键词: 木薯;FER基因;生物信息学分析;非生物胁迫
期刊名称: 热带亚热带植物学报
ISSN: 1005-3395
年卷期: 2024 年 003 期
页码: 435-445
收录情况: 北大核心 ; CSCD
摘要: 植物铁蛋白(Ferritin, FER)既能存储铁,又能响应各种非生物胁迫。该研究基于全基因组水平对木薯(Manihot esculenta)的FER基因家族进行分析,结果表明,从木薯中共鉴定到4个FER基因,根据系统发育树将木薯FER基因划分为2支,所有成员均包含Euk_Ferritin的功能结构域并位于叶绿体内。木薯FERs基因位于LG7~LG10染色体上;基因共线性分析表明,共有3对潜在的复制基因对,无串联重复事件;Ka/Ks值表明,MeFER同源基因经过了纯化选择;该家族含有响应激素和胁迫诱导的顺式作用元件;q RT-PCR分析表明,MeFER基因的表达具有组织特异性,MeFER4基因响应多种胁迫,且在干旱胁迫下响应最为显著。该研究为木薯FER基因家族的功能研究奠定了基础。
分类号: S533%Q943.2
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