基于转录组信息的艾纳香牻牛儿基焦磷酸合成酶基因(BbGPPS)的克隆及序列分析
文献类型: 中文期刊
第一作者: 官玲亮
作者: 官玲亮;夏奇峰;石小兵;蓝惠萍;陈振夏;赵致;庞玉新
作者机构:
关键词: 艾纳香;牻牛儿基焦磷酸合成酶;氨基酸序列;系统发育分析
期刊名称: 热带作物学报
ISSN: 1000-2561
年卷期: 2016 年 05 期
页码: 901-909
收录情况: 北大核心 ; CSCD
摘要: 采用RT-PCR和RACE(Rapid amplification of cDNA ends)技术,从艾纳香(Blumea balsamifera L.DC)的叶片中克隆到单萜化合物合成的关键酶牻牛儿基焦磷酸合成酶(BbGPPS)基因。研究结果显示,BbGPPS基因的cDNA全长1 692 bp,包含开放阅读框(ORF)1 083 bp,编码361个氨基酸;亚细胞结构定位于叶绿体,既非膜蛋白也非分泌性蛋白。疏水性分析显示,BbGPPS是亲水性蛋白。同源性比对结果显示,BbGPPS蛋白与其他植物中GPPS蛋白具有高度的相似性,且具有异戊烯基结构域。系统发育分析表明,所有序列被聚为5大类,BbGPPS与其他菊科植物聚类一类,与万寿菊(Tagetes erecta)TeGPPS亲缘关系最近,其次是甜菊(Stevia rebaudiana)SrGPPS。
分类号: S567.239`Q943.2
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