莴笋红叶基因图位克隆及分子标记开发

文献类型： 中文期刊

第一作者： 李春

作者： 李春;何振;刘小俊;梁根云;李艺凡;杨楠;蔡鹏;李跃建;房超;刘独臣

作者机构：

关键词： 莴笋;红叶;图位克隆;分子标记

期刊名称： 四川农业大学学报

ISSN：

年卷期： 2024 年 003 期

页码： 523-528

收录情况： 北大核心 ; CSCD

摘要： [目的]研究莴笋叶色变异的遗传基础,加速莴笋新品种育种进程,提高育种效率.[方法]通过构建红叶和绿叶莴笋杂交群体,分析遗传规律,利用混池分组分析法(BSA-seq)和图位克隆法精细定位并克隆了莴笋红叶基因Lactuca sativa Red Leaf 1(LsRL1),根据变异位点设计了分子标记用于红叶莴笋分子标记辅助育种.[结果]遗传分析结果显示F2分离群体中红叶个体与绿叶个体的分离比为3∶1,说明研究中莴笋叶色表型受一个基因控制,且红叶相对于绿叶为显性性状.混池分组分析法(BSA-seq)将莴笋叶色基因LsRL1初步定位在莴笋第5染色体336.00 Mb到339.64 Mb的范围内.利用图位克隆的方法进一步将LsRL1基因的范围缩小至2个Indel分子标记ls06和ls12之间的85.17 kb区间内,这一区间内包含2个基因LOC111892298和LOC111892911.亲本间差异位点分析将LsRL1的候选基因确定为LOC111892911,该基因在拟南芥中的同源基因编码一个bHLH转录因子,参与花青素合成途径的调控.[结论]基于LsRL1基因在2个亲本间的插入缺失变异,我们开发了一个可用于红叶莴笋分子标记辅助育种的Indel标记,以加速红叶莴笋的育种进程.

分类号： S636.2

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