猪圆环病毒同义密码子的使用模式及其影响因素

文献类型： 中文期刊

第一作者： 牟一娇

作者： 牟一娇;吴润;王永录

作者机构：

关键词： 猪圆环病毒;密码子使用模式;突变压力;自然选择

期刊名称： 安徽农业科学

ISSN： 0517-6611

年卷期： 2013 年 41 卷 01 期

页码： 149-151

收录情况： 北大核心

摘要： [目的]揭示猪圆环病毒(PCV)基因组的进化特点和遗传多样性。[方法]通过计算PCV基因组的相对同义密码子使用频率(RSCU)、有效密码子数目(ENC)和核苷酸含量等指标,对PCV基因组的密码子使用模式进行了综合分析。[结果]PCV基因组具有较低的GC含量和低的密码子偏好性,不同基因型的PCV在密码子使用上具有显著差异,并且PCV与圆环病毒科中的其他病毒的密码子使用模式也存在差异。PCV与其宿主的密码子使用模式存在一定程度的相似性。此外,地理因素、蛋白质总的平均疏水性和芳香性等可能与PCV的密码子使用模式的形成有关。[结论]PCV基因组的密码子使用模式的形成是突变压力与自然选择相互作用的结果。该研究对阐明PCV的密码子使用规律以及分子进化过程提供了最新的信息。

分类号： S858.28

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