温度变化对钾离子跨膜通道蛋白传输能力的影响

文献类型： 中文期刊

第一作者： 李代禧

作者： 李代禧;刘宝林;乔勇进;张燕;翟振

作者机构：

关键词： 冷害;离子通道蛋白;分子动力学模拟;伞状采样;PMF自由能

期刊名称： 计算机与应用化学

ISSN： 1001-4160

年卷期： 2012 年 04 期

页码： 405-408

收录情况： 北大核心 ; CSCD

摘要： 为了研究温度变化对生物膜跨膜传输能力的影响,本文以钾离子跨膜通道蛋白为研究对象,利用Gromacs分子生物学模拟软件包和Gromos96(53a6)分子力场,通过分子动力模拟技术和伞状采样方法详细研究了300K和275K两个温度条件下钾离子跨膜通道蛋白对单个钾离子的传输机理和Potentials of Means Force自由能在整个传输过程中的变化曲线。分析伞状采样的计算结果表明,温度的下降对钾离子跨膜通道蛋白的传输能力具有较大影响,300K时,钾离子在跨膜通道蛋白中的传输过程是热力学自发过程;然而,当温度下降到275K后,跨膜通道蛋白前沿空腔对钾离子的捕捉能力明显下降,选择性位点的能垒和传输通道的自由能普遍上升,导致跨膜通道蛋白出口的自由能高于其入口的自由能,最终使钾离子跨膜通道蛋白对钾离子传输方向发生逆转。同时该结果还可以对冷害发生的机理和防治给予重要的启示:说明温度下降后,果蔬体内物质传输能力的下降和停滞是造成冷害发生的一个主要原因。

分类号： Q25

  • 相关文献

[1]基于分子动力学模拟的直链淀粉风味分子包合物形成机理的研究. 冯涛,刘芳芳,荣志伟,庄海宁,刘轶. 2015

[2]石墨烯与抑癌基因p53 DNA片段相互作用的分子模拟与光谱学验证. 吴惠丰,张明兴,李斐,曹天贵,李雪花,赵建民. 2017

[3]肌红蛋白血红素辅基氧化修饰对肌球蛋白结构性质的影响. 朱宏星,王道营,徐为民,孙冲,葛庆丰,高田毅,黄杨. 2020

[4]分子动力学模拟研究直链淀粉与α-亚油酸的包合行为. 冯涛,王旭,庄海宁,Feng Chen,Bruce R Hamaker,Osvaldo Campanella,王凯. 2016

[5]虾壳源多肽酶解条件的优化及其抗冻活性和作用机制的探究. 刘铭利,白顺杰,邱亮,涂子仪,于巍,廖涛. 2024

[6]悬铃木方翅网蝽化学感受蛋白CcilCSP1的结构及其结合寄主挥发物的预测分析. 付宁宁,刘佳,渠成,王然,许奕华,罗晨,李峰奇. 2017

[7]液滴在超疏水植物叶面的沉积：实验和分子动力学模拟（英文）. 曹冲,张裴,曹立冬,刘铭鑫,宋玉莹,陈鹏,黄啟良,韩布兴. 2022

[8]海洋低温脂肪酶MLP的同源模建及分子动力学模拟. 纪晓峰,盛军,郑媛,郝建华,孙谧. 2013

[9]分子动力学模拟分析超高压对固液两态多酚氧化酶稳定性的影响. 李镜浩,梁展鸿,肖更生,徐玉娟,余元善,吴继军,彭健,李璐,程丽娜. 2024

[10]基于计算模拟与响应面分析漆酶对己烯雌酚的降解作用. 刘红艳,谢世伟,唐琳,张文强,张国琴,朱义年,单杨. 2020

[11]通过分子动力学模拟方法研究c-Myb在mim-1启动子区域伪回文序列的结合特性揭示DNA特异性识别机制（英文）. 翁金如,杨朔,沈金康,刘宏森,许煜梓,郝东云,王杉. 2023

[12]芥子酸对含壳聚糖的模型饮料中花色苷的保护作用. 艾欣,潘飞,朱泽辉,张铭昕,刘雅琪,赵磊,赵亮. 2024

[13]芬顿反应制备低分子量硫酸软骨素及其降解机制. 王康宇,王雯芳,侯成立,郭玉杰,张春晖. 2023

[14]棉花冷害与育种. 尹飞虎. 2002

[15]贵州冷害天气对栽桑养蚕的影响及对策. 杨胜特,王文学,李开林. 2010

[16]低温对辣椒贮藏特性的影响. 蓬桂华,韩世玉,张爱民,杨万荣,赖卫. 2014

[17]贵州主要热作果树低温灾害的调查研究. 王代谷,田大青,李家兴. 2011

[18]香蕉寒害及防寒栽培技术研究进展. 吴代东,邹瑜,林贵美,张进忠. 2012

[19]硼锌微量元素对遇冷害黄瓜恢复生长的效果. . 2008

[20]黑龙江省水稻冷害产量试验模型研究. 许显滨,卞景阳,谭贺,李炜,王立志,中本和夫. 2009

作者其他论文 更多>>

微信小程序