小麦VQ家族全基因组鉴定与表达分析
文献类型: 中文期刊
第一作者: 李虎滢
作者: 李虎滢;魏春茹;孟钰玉;范润侨;于秀梅;刘大群
作者机构:
关键词: 小麦;VQ基因家族;生物信息学分析;表达模式
期刊名称: 分子植物育种
ISSN: 1672-416X
年卷期: 2020 年 02 期
页码: 358-366
收录情况: 北大核心 ; CSCD
摘要: 近年来,VQ蛋白因发现与WRKY转录因子相互作用而引起广泛关注。目前,关于VQ基因家族在小麦中的研究鲜有报道。为了解小麦VQ基因的存在数量和结构等特征,本研究采用生物信息学技术在小麦基因组中鉴定了25个小麦VQ基因,并对其编码蛋白的结构、性质、亚细胞定位和进化关系进行了分析。结果表明,大多数小麦VQ蛋白序列较短,为中性或偏碱性蛋白,由单外显子基因编码;小麦VQ蛋白主要分布于细胞核中。25个VQ基因不均匀地分布在21条小麦染色体上,片段复制是小麦VQ基因家族的主要扩张方式。通过基因表达模式分析,发现部分小麦VQ基因响应干旱和高温的胁迫,并呈组织表达特异性。研究结果为进一步分析该家族成员,并深入探讨其在小麦中的生物学功能和进化模式奠定了基础。
分类号: S512.1
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