小麦bHLH家族转录因子的鉴定及其在盐胁迫条件下的表达分析
文献类型: 中文期刊
第一作者: 吕宝莲
作者: 吕宝莲;杨宇昕;崔立操;史峰;马亮;孔秀英;张立超;倪志勇
作者机构:
关键词: 小麦;bHLH转录因子;盐胁迫;生物信息学分析
期刊名称: 作物杂志
ISSN:
年卷期: 2024 年 001 期
页码: 65-72
收录情况: 北大核心 ; CSCD
摘要: 碱性螺旋―环―螺旋(basic helix-loop-helix,bHLH)转录因子作为植物中第二大类转录因子家族,在植物生长发育、信号传导、生物合成以及响应非生物胁迫等方面发挥重要功能。为了探讨小麦bHLH转录因子在盐胁迫应答中的功能,以冬性小麦科农199为试验材料,通过转录组测序和生物信息学分析的方法对小麦bHLH转录因子在盐胁迫下的表达特性进行系统分析。结果表明,小麦中共有489个bHLH转录因子,分布在21条染色体上;构建系统进化树将bHLH家族进一步划分为9个亚族,其中VI亚族成员最多,IV亚族成员最少;盐胁迫下小麦根转录组测序结果表明,在盐胁迫处理后1和6h差异表达基因(DEG)共有44个,其中上调表达的基因有17个,下调表达的有27个;GO分析表明,DEG富集在水、盐胁迫、生长素调节等方面;KEGG注释分析表明,DEGs主要富集在淀粉和蔗糖代谢途径以及氨基糖和核苷酸糖代谢等信号通路;对部分DEG进行qRT-PCR验证,结果表明DEG的表达模式与转录组测序结果一致,证明了RNA-Seq结果的准确性。
分类号: S512.1%Q943.2
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