大麦SERK基因家族cDNA克隆及生物信息学分析

文献类型： 中文期刊

第一作者： 杨沙沙

作者： 杨沙沙;李颖波;谭何新;郭桂梅;何婷;陈志伟;刘成洪;黄剑华

作者机构：

关键词： 大麦;SERK;注释;克隆;生物信息学分析

期刊名称： 上海农业学报

ISSN： 1000-3924

年卷期： 2016 年 32 卷 03 期

页码： 5-13

收录情况： 北大核心 ; CSCD

摘要： 通过对大麦体细胞胚胎发生受体类蛋白激酶SERK(Somatic embryogenesis receptor-like kinases)基因家族进行注释和基因克隆,得到3条大麦序列,即HvSERK1、HvSERK2和HvSERK3,其中基因HvSERK3与相应已有参考序列(Accession:AK374641)相比,编码氨基酸有所改变。生物信息学分析表明:3条大麦SERK基因都具有1 870 bp左右的开放阅读框,620 aa左右的氨基酸残基数,69 kD左右的相对分子质量大小,平均理论等电点5.5,说明SERK为酸性蛋白;大麦SERK蛋白具有强烈的亲水性,且存在N端信号肽和跨膜螺旋区,二级结构组件主要是环(loop)。本研究为进一步探讨大麦中SERK基因家族的功能奠定了基础。

分类号： S512.3

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