芦竹TCP家族的基因鉴定与盐胁迫下的表达分析

文献类型： 中文期刊

第一作者： 刘璇

作者： 刘璇;陈虞超;郭生虎;钟楠;石磊;甘晓燕

作者机构：

关键词： 芦竹;TCP转录因子;基因家族鉴定;盐胁迫;表达分析

期刊名称：

ISSN： 1001-0629

年卷期： 2024 年 41 卷 10 期

页码： 2316-2329

摘要： 芦竹(Arundo donax)生长周期短，纤维素及粗蛋白含量高，是一种新型的经济能源饲草，具有广阔的应用前景。TCP是一类植物特有的转录因子，在调控植物生长发育过程中具有重要作用，但目前该基因家族在芦竹中的分布以及生物学功能未见报道。本研究以芦竹为对象，利用生物信息学方法对AdTCP基因家族的基本理化性质、染色体定位、基因间的共线性关系、基因结构、蛋白的保守基序、多序列比对以及与其他物种的亲缘进化关系进行了系统分析，并运用实时荧光定量PCR测定了盐胁迫下7个AdTCP基因的相对表达量。结果表明，芦竹含有37个AdTCP基因，分布在不同染色体上，其蛋白理化性质各不相同，且均为亲水性、不稳定蛋白，多数定位在细胞核中。AdTCP家族基因结构中均只含有外显子，无内含子，共线性分析鉴定出22个片段复制基因对；其家族蛋白包含15个不同的保守基序，序列相似性为30.52%。通过与拟南芥(Arabidopsis thaliana)、水稻(Oryza sativa)TCP基因进行亲缘关系比较，结果发现82个TCPs可以分为TCP-P和TCP-C两大亚家族，其中TCP-P仅包含PCF分支，而TCP-C包含CYC与CIN两个分支。随着盐胁迫浓度的升高，7个AdTCP基因的表达量呈现先上升后下降的趋势，说明AdTCP参与盐胁迫响应过程。本研究为解析芦竹基因功能及创制芦竹新种质奠定了基础。

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