利用变性梯度凝胶电泳分析正红菇菌根围土壤真菌群落多样性

文献类型： 中文期刊

第一作者： 肖冬来

作者： 肖冬来;陈丽华;陈宇航;杨菁;黄小菁

作者机构：

关键词： 正红菇;菌根围;真菌多样性;PCR变性梯度凝胶电泳

期刊名称： 热带作物学报

ISSN： 1000-2561

年卷期： 2013 年 34 卷 12 期

页码： 2508-2512

收录情况： CSCD

摘要： 以正红菇(Russula griseocarnosa)菌根围土壤为研究对象,通过提取土壤基因组DNA,以通用引物扩增真菌18S rRNA基因V1+V2区,将PCR产物进行变性梯度凝胶电泳(Denaturing Gradient Gel Electrophoresis),获得土壤微生物群落的DNA特征指纹图谱,并对图谱中的优势条带回收测序,通过Blast进行同源性比对并构建系统发育树,进而分析正红菇菌根围真菌群落组成及多样性。同源性比对结果表明,在回收测序的19条DGGE条带中,4条为非真菌真核生物序列,系统发育分析显示全部序列可以分为4类菌群,GroupⅠ主要为担子菌门(Basidiomycota)真菌,GroupⅡ主要为子囊菌门(Ascomycota)真菌,GroupⅢ为未知真菌,GroupⅣ主要为节肢动物门生物(Arthropoda)。

分类号： S154.3

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