杏NBS基因家族鉴定及其对果实抗病性的影响
文献类型: 中文期刊
第一作者: 秦兆辉
作者: 秦兆辉;张俊环;杨丽;张美玲;王玉柱;姜凤超;孙浩元
作者机构:
关键词: 杏(Prunus armeniaca L.);NBS基因家族;抗病育种;生物信息学
期刊名称: 果树学报
ISSN: 1009-9980
年卷期: 2022 年 003 期
页码: 321-331
收录情况: 北大核心 ; CSCD
摘要: 【目的】探讨杏果实发育过程中NBS基因家族的表达规律,为果实抗病机制研究提供理论指导。【方法】运用生物信息学方法进行NBS基因家族鉴定与转录组分析。【结果】在串枝红杏基因组中共鉴定到155个NBS抗病基因,主要分为CNL型(126个)和NL型(29个),45%的基因主要分布在1号与2号染色体上,顺式作用元件较多且大多属于激素调控元件,发现1个杏特有的基序CNBS-1。NBS基因在不同品种发育过程中的基因表达模式类似,但在表达量上存在较大差异。8个NBS基因在串枝红果实发育的4个时期表达量均显著高于同时期大白杏,表明这些基因可能与串枝红果实抗病性高于大白杏有关。【结论】获得8个NBS差异表达基因,主要与抗致病疫霉病原与霜霉病原有关,为杏果实抗病育种提供理论指导。
分类号: S436.629%S662.2
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