文献类型： 中文期刊
作者： 纪薇 1 ; 焦晓博 1 ; 罗尧幸 1 ; 赵伟 1 ; 郭雯岩 1 ; 刘榕晨 1 ; 赵旗峰 1 ; 马小河 1 ;
作者机构： 1.山西农业大学园艺学院;果树种质创制和利用山西省重点实验室;农业农村部黄土高原作物基因资源与种质创制重点实验室;山西省农业科学院果树研究所
关键词： 葡萄;RNA-Seq;新转录本预测;基因结构优化
期刊名称： 植物生理学报
ISSN： 2095-1108
年卷期： 2019 年 05 期
页码： 617-628
收录情况： 北大核心 ; CSCD
摘要： 由于葡萄(Vitis spp.)基因组注释的不完善,本文以3个生长时期3种性状葡萄花器官(雌能花、雄花和两性花)为材料提取总RNA进行高通量测序,开展了葡萄新转录本发掘和已注释基因结构优化工作。获得173.41Gb高质量的过滤后的数据(clean data),发掘出839个新转录本,其中697个新转录本得到了注释信息,同时对10 163个已注释基因的结构进行了优化。本研究旨在为后续葡萄基因组学、表型研究和其他生物基因组注释信息的完善提供参考。
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