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基于IRAP标记的沙子空心李遗传多样性评价及指纹图谱构建

文献类型: 中文期刊

作者: 王贵 1 ; 李蕊蕊 1 ; 吴茂宏 2 ; 任菲宏 3 ; 王丽丽 4 ; 乔光 1 ;

作者机构: 1.贵州大学生命科学学院/山地植物资源保护与种质创新教育部重点实验室

2.贵州省铜仁市林业科学院

3.贵州省铜仁市农业科学院

4.贵州省农业科学院

关键词: 沙子空心李;种质资源;分子标记;IRAP;指纹图谱;遗传多样性;种质创新

期刊名称: 华中农业大学学报

ISSN: 1000-2421

年卷期: 2023 年 42 卷 001 期

页码: 1-11

收录情况: 北大核心 ; CSCD

摘要: 通过走访调查,选取92株具有优良性状的沙子空心李种质,根据李反转录转座子的RT序列开发IRAP标记引物,设计L16(43)的正交试验优化10μL IRAP-PCR主要影响因素的含量;利用18条IRAP引物对92份沙子空心李进行遗传多样性分析,构建供试种质的指纹图谱.结果显示:最优的10μL IRAP-PCR反应体系为10-5 mol/L IRAP引物l.3μL,PCR Mix 5.0μL、模板DNA(30 ng/μL)l.0μL,PCR循环40次.18条IRAP引物共扩增出189个位点,多态性位点180个,等位基因数、有效等位基因数、Nei's基因多样性指数和Shannon指数均值分别为1.930、1.426、0.261及0.405.采用邻接法将92份沙子空心李聚类为4个类群.确定IRAP引物Ty3-2及Ty3-6为核心引物,可高效构建92份供试种质的指纹图谱.

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