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斑玉蕈栽培菌株遗传变异与生长速率GWAS分析

文献类型: 中文期刊

作者: 龚明 1 ; 李燕 1 ; 鲍大鹏 1 ; 尚俊军 1 ; 杨瑞恒 1 ; 周陈力 1 ; 万佳宁 1 ; 吴莹莹 1 ;

作者机构: 1.上海市农业科学院食用菌研究所农业农村部南方食用菌资源利用重点实验室国家食用菌工程技术研究中心国家食用菌加工技术研发分中心上海市农业遗传育种重点开放实验室

关键词: 斑玉蕈;遗传变异;生长速率;SNP;GWAS

期刊名称: 食用菌学报

ISSN: 1005-9873

年卷期: 2021 年 002 期

页码: 18-25

收录情况: 北大核心 ; CSCD

摘要: 以38份斑玉蕈(Hypsizygus marmoreus)种质资源为研究对象,采用全基因组重测序获得供试菌株的SNP(single nucleotide polymorphism)数据,结合在不同温度(10、15、20、25、30℃)下的菌丝生长速率测定结果,开展全基因组关联分析(genome wide association study, GWAS)。结果表明:供试群体分为4大类群;在实验范围内,20、25℃为斑玉蕈适宜生长温度;GWAS分析显示20、25℃分别存在10、14个与生长速率显著关联的SNP位点,其中1个属于潜在功能性SNP位点。

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