文献类型： 中文期刊

作者： 万春和 ¹ ; 程龙飞 ¹ ; 陈红梅 ¹ ; 傅光华 ¹ ; 施少华 ¹ ; 黄瑜 ¹ ;

作者机构： 1.福建省农业科学院畜牧兽医研究所

关键词： 鸭疫里默氏菌;铁依赖抑制子基因;克隆;生物信息学分析

期刊名称： 中国畜牧兽医

ISSN： 1671-7236

年卷期： 2014 年 41 卷 12 期

页码： 85-89

收录情况： 北大核心

摘要： 本研究根据鸭疫里默氏菌铁依赖抑制子(RaDtxR)基因序列特征设计特异性引物,利用PCR方法从已鉴定为2型鸭疫里默氏菌RA-FJ株的基因组DNA中扩增目的基因片段,胶回收PCR扩增片段,克隆到pMD18-T载体后进行序列测定。采用生物信息学软件对测序结果进行分析,结果表明所获得的RaDtxR基因编码完整的开放阅读框,全基因长度为654bp,编码217个氨基酸。所编码的蛋白大小为24.82ku,理论等电点为5.69,不稳定系数为38.45,属于稳定蛋白质类。将其与GenBank中已发表的RaDtxR基因序列进行核苷酸同源性比对分析,结果显示其与鸭疫里默氏菌疫苗株RA-CH-1株(GenBank登录号:CP003787)的核苷酸同源性为100.0%,与其他4株核苷酸同源性均为99.8%,仅在186位处存在无义突变。利用该基因对福建省农业科学院畜牧兽医研究所分离鉴定的鸭大肠杆菌、禽多杀性巴氏杆菌和沙门氏菌进行扩增,结果显示均未扩增到条带,对福建省农业科学院畜牧兽医研究所分离鉴定的1型、2型、3型、11型和13型鸭疫里默氏菌均可扩增出特异性目的条带,表明RaDtxR基因可作为鸭疫里默氏菌鉴别诊断的靶基因。试验结果表明,本研究成功克隆到鸭疫里默氏菌RaDtxR基因,为研究其功能奠定基础。