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猪miR-148a-3p的生物信息学分析与靶基因验证

文献类型: 中文期刊

作者: 齐婧 1 ; 谭娅 1 ; 裴国海 2 ; 张静 1 ; 龙建华 3 ; 赵春萍 1 ; 杜春林 1 ; 王婧 1 ; 田景红 4 ; 史开志 1 ;

作者机构: 1.贵州省农业科学院畜牧兽医研究所

2.松桃苗族自治县农业农村局

3.贵阳市乌当区新场镇农业综合服务中心

4.松桃苗族自治县健达动物防疫专业合作社联合社

关键词: 柯乐猪;miR-148a-3p;PRLR;卵巢;繁殖性状

期刊名称: 中国畜牧杂志

ISSN: 0258-7033

年卷期: 2025 年 61 卷 009 期

页码: 191-201

收录情况: 北大核心

摘要: miR-148a-3p是前期课题组通过转录组测序发现的在猪卵巢组织中高表达的小RNA(microRNAs,miRNAs)之一,为探究miR-148a-3p对猪繁殖性状的调控作用,本研究围绕miR-148a-3p序列开展进化分析、靶基因预测及功能富集分析、组织表达分析,并通过双荧光素酶报告系统验证靶标关系.结果表明,各物种miR-148a-3p的第 2~8 位碱基完全一致,猪miR-148a-3p与人(Homo sapiens)、小鼠(Mus musculus)和猕猴(Macaca mulatta)亲缘关系较近;对miR-148a-3p靶基因进行GO和KEGG功能富集分析发现,miR-148a-3p的靶基因可富集到子宫内胚胎发育、正向调控转移酶活性、酶联受体蛋白信号通路、PI3K-Akt、TGF-β和MAPK信号通路等与动物繁殖相关的信号通路中.miR-148a-3p可与PRLR基因的CDS区域结合.RT-qPCR结果显示,miR-148a-3p在保育猪卵巢组织中的表达量最高且极显著高于其他组织,且在黄体期的卵巢组织中,miR-148a-3p和PRLR的表达量呈负相关趋势.双荧光素酶报告系统结果显示,超表达miR-148a-3p能显著抑制PRLR野生型载体的荧光活性.综上,miR-148a-3p与PRLR存在靶向关系,且可靶向PRLR-CDS区域,为进一步探究miR-148a-3p调控繁殖性状的分子机制提供了依据.

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