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巨桉CLE基因家族鉴定及表达分析

文献类型: 中文期刊

作者: 李靖思 1 ; 陆钊华 2 ; 杨德明 2 ; 秦健 3 ; 李光友 2 ;

作者机构: 1.柳州市都乐公园管理处

2.中国林业科学研究院热带林业研究所国家林业和草原局热带林业重点实验室

3.广东省农业科学院果树研究所农业农村部南亚热带果树生物学与遗传资源利用重点实验室广东省果树科学与技术研究重点实验室

关键词: 巨桉;短肽信号;CLE;基因家族;表达模式

期刊名称: 林业科学研究

ISSN: 1001-1498

年卷期: 2025 年 38 卷 004 期

页码: 42-52

收录情况: 北大核心 ; CSCD

摘要: [目的]鉴定巨桉CLE短肽家族成员,解析EgCLE基因在不同组织部位、激素处理和胁迫响应的表达模式,进而深入了解其在巨桉生长发育中的作用。[方法]通过生物信息学方法对巨桉CLE基因家族成员进行全基因组鉴定,并对其理化性质、染色体定位、进化与基因结构、蛋白保守结构域、启动子元件和表达模式进行分析。[结果]从巨桉基因组中共鉴定出13个EgCLE基因,不均匀分布在6条染色体上。从13个EgCLE基因中分离出12种十二氨基酸CLE肽,其中9个A型CLE肽,2个B型CLE肽,1个未知类型CLE肽。EgCLE基因编码83~140个氨基酸,绝大部分为酸性疏水性蛋白且均不稳定。大部分EgCLE基因为单外显子结构,且motif1在EgCLE家族中非常保守。顺式作用元件分析发现EgCLE家族成员启动子区域中包含多个生长发育、激素应答与胁迫响应元件。表达分析显示大多数EgCLE基因存在组织特异性表达模式。EgCLE基因对SA处理不敏感,而JA处理对EgCLE基因的表达量影响较大。部分EgCLE基因如EgCLE16、EgCLE27响应盐胁迫与营养胁迫。[结论]巨桉CLE基因家族成员在巨桉器官发育中起着重要的调控作用,EgCLE作为重要的短肽信号分子作用于巨桉的初生与次生生长、非生物胁迫响应等生物学过程,研究结果为后续解析EgCLE基因调控巨桉生长发育的分子机制提供理论基础。

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