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香蕉MYB转录因子基因的电子克隆及生物信息学分析

文献类型： 中文期刊

作者： 谭琳 1 ; 康由发 2 ; 郑晓燕 3 ; 黄丽娜 1 ; 陈娇 3 ; 马蔚红 3 ;

作者机构： 1.中国热带农业科学院热带作物品种资源研究所/农业部华南作物基因资源与种质创制重点实验室

2.海南大学城西校区管委会

3.中国热带农业科学院海口实验站/海南省香蕉遗传改良重点实验室

关键词： 香蕉;MYB基因;电子克隆;生物信息学

期刊名称： 广东农业科学

ISSN： 1004-874X

年卷期： 2015 年 42 卷 04 期

页码： 123-128+193

收录情况： 北大核心 ; CSCD

摘要： 采用电子克隆方法获得香蕉MYB基因。通过生物信息学方法,对此序列编码的蛋白质从氨基酸组成、理化性质、疏水性/亲水性、结构域及其空间结构等方面进行了预测和分析。结果表明:香蕉MYB基因编码序列全长1 266 bp,包含1 266 bp的开放阅读框,编码413个氨基酸,含有1个保守的MYB功能域、1个SANT保守结构域。在序列组成、理化性质、结构域及空间构象等方面,与小麦等其他植物的MYB转录因子具有高度的相似性。

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