文献类型： 中文期刊

作者： 李强 ¹ ; 李涛 ² ; 郭世华 ¹ ; 白玉婷 ¹ ; 李星聪 ¹ ;

作者机构： 1.内蒙古农业大学农学院

2.内蒙古自治区农牧业科学院作物所

关键词： 粳谷;糯谷;酶活性;灌浆期;转录组;RT-qPCR

期刊名称： 分子植物育种

ISSN：

年卷期： 2021 年 013 期

页码： 4198-4205

收录情况： 北大核心 ; CSCD

摘要： 小米直链淀粉与支链淀粉的含量是影响蒸煮和食味品质的重要性状。粳谷和糯谷在籽粒灌浆期淀粉合成的途径和成分不同。利用高通量测序技术Illumina Hiseq4000对糯谷‘公谷68’和粳谷‘赤谷4号’（灌浆期第1天和第5天）未成熟籽粒进行转录组测序。结果表明:（1）糯谷和粳谷GBSSⅠ酶活性均呈低-高-低的趋势,二者活性大小存在一定差异。糯性品种‘公谷68’灌浆期第5天与第1天筛选出665个上调差异表达基因,上调基因较下调基因多431个;粳性品种‘赤谷4号’灌浆期第5天与第1天上调基因较下调基因多97个。（2）糯谷A₂-VS-A₁比较组差异基因GO富集在生物过程和分子功能,如种子油体生物发生、17-β-酮类固醇还原酶活性等7个功能;粳谷B₂-VS-B₁差异基因GO富集在光系统Ⅰ中的光捕获、色素结合等8个功能。（3）糯谷A₂-VS-A₁差异基因KEGG主要富集于咖啡因代谢、亚油酸代谢、花青素的生物合成和黄曲霉毒素生物合成途径,粳谷B₂-VS-B₁差异基因KEGG主要富集在光合作用-天线蛋白、亚油酸代谢、咖啡因代谢、油菜素类固醇生物途径,粳糯两个比较组富集过程均包括咖啡因代谢和亚油酸代谢途径。（4）糯谷和粳谷两个比较组中分别筛选到3个（SSⅡ-3, PHO1, AS）和4个（PHO1-1, AS, AGP16, WAX）差异较大且与胚乳粳、糯性相关的基因。以Actin （Si001873）为内参基因,将上述7个差异基因进行RT-qPCR验证,与转录组结果相吻合,说明差异基因与胚乳粳糯性相关。