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三角帆蚌微卫星富集文库的构建、鉴定及多态性分析

文献类型： 中文期刊

作者： 许巧情 1 ; 谢骏 1 ; 张书环 2 ; 赵朝阳 1 ; 袁汉文 3 ;

作者机构： 1.中国水产科学研究院

2.中国科学院水生生物研究所

3.长江大学

关键词： 三角帆蚌;微卫星富集文库;PCR扩增;多态性

期刊名称： 中国水产科学

ISSN： 1005-8737

年卷期： 2010 年 17 卷 06 期

页码： 1200-1207

收录情况： 北大核心 ; CSCD

摘要： 通过磁珠富集法构建了三角帆蚌(Hyriopsis cumingii)微卫星富集文库。共获得800个阳性克隆,其中的100个阳性克隆经测序分析,共获得微卫星序列54个。利用这些微卫星序列可设计33对引物,经过PCR扩增筛选获得了25对可用引物。利用聚丙烯酰胺凝胶电泳,对洞庭湖1个种群的30只三角帆蚌进行扩增,发现13对引物呈现多态性,等位基因数在4～9。观测杂合度在0.2543～0.9827,期望杂合度在0.3629～0.8217,信息多态含量平均为0.5198。由于存在无效等位基因,两个微卫星基因座(GenBank登录号为GQ302651和GQ302658)明显地偏离哈代-温伯格平衡,但没有发现连锁不平衡现象。这说明利用磁珠富集法构建的三角帆蚌微卫星文库质量较好,13对多态性微卫星引物可为三角帆蚌微卫星连锁图谱构建、分子进化和系统发育研究、分子标记辅助育种以及经济性状的QTL定位提供帮助。

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