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大白菜InDel-PCR反应体系的优化

文献类型: 中文期刊

作者: 梁爽 1 ; 原玉香 2 ; 张晓伟 2 ; 薛银鸽 1 ; 姚秋菊 2 ; 蒋武生 2 ; 田保明 1 ; 张强 2 ; 赵艳艳 2 ;

作者机构: 1.郑州大学生物工程系

2.河南省农业科学院园艺研究所

关键词: 大白菜;InDel;PCR;条件优化

期刊名称: 河南农业科学

ISSN: 1004-3268

年卷期: 2012 年 41 卷 09 期

页码: 110-113

收录情况: 北大核心 ; CSCD

摘要: 采用CTAB法提取大白菜基因组DNA,利用单因素试验对InDel-PCR反应体系中的dNTPs浓度、Mg2+浓度、Taq DNA聚合酶用量、模板DNA用量、引物浓度、退火温度、三温循环时间等7个因素进行筛选和优化。结果表明,适用于大白菜InDel-PCR分析的最佳扩增条件为(20μL):dNTPs 0.1mmol/L、Mg2+1.5mmol/L、Taq DNA聚合酶0.4U、模板DNA 105ng、引物浓度0.4μmol/L、退火温度50℃、三温循环时间30s-30s-45s。该体系可用于大白菜遗传多样性分析及遗传图谱构建。

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