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冠突散囊菌有性产孢相关基因的生物信息学分析

文献类型： 中文期刊

作者： 王玉臣 1 ; 谭玉梅 1 ; 刘作易 2 ; 刘永翔 1 ;

作者机构： 1.贵州省生物技术研究所

2.贵州省农业生物技术重点实验室

关键词： 冠突散囊菌;nsdD;esdC;flbA;生物信息学

期刊名称： 贵州农业科学

ISSN： 1001-3601

年卷期： 2014 年 10 期

页码： 32-36

收录情况： 北大核心

摘要： 为研究nsdD、esdC及flbA等基因在冠突散囊菌(Eurotium cristatum)中的功能,通过Augustus软件对这3个基因进行重新预测,并利用ExPASy网站中的生物信息分析工具及多序列比对构建系统发育树对这3个基因编码蛋白的性质、结构及其功能进行推测。结果表明:nsdD、esdC及flbA分别编码含有430个、274个和764个氨基酸的蛋白。3个蛋白均不具有信号肽,推测为非分泌蛋白;且均不具有跨膜结构,亚细胞定位发现NsdD和EsdC位于细胞核内,而FlbA可能位于线粒体上;3个蛋白在曲霉中均比较保守。nsdD、esdC和flbA 3个基因均参与冠突散囊菌有性发育的调控。

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