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鲢InDel-RFLP标记开发及其在连锁图谱构建中的应用

文献类型: 中文期刊

作者: 张鹏 1 ; 杨官品 1 ; 张立楠 1 ; 危起伟 2 ; 邹桂伟 2 ;

作者机构: 1.中国海洋大学

2.中国水产科学研究院长江水产研究所

关键词: 鲢(Hypophthalmichthys molitrix);碱基插入缺失;限制性片段长度多态性;连锁图谱

期刊名称: 淡水渔业

ISSN: 1000-6907

年卷期: 2011 年 41 卷 02 期

页码: 43-48+50+29

收录情况: 北大核心 ; CSCD

摘要: 基于随机测序的鲢(Hypophthalmichthys molitrix)基因组片段,尝试开发基于InDel的限制性片段长度多态性标记(InDel-RFLP)。结果显示:共133个片段中,65个在一个野生鲢群体(该野生鲢群体采自长江流域荆州段,31个个体)中表现多态性。共检测到163个等位基因,每位点等位基因数从2到4不等,平均2.5个。65个多态性标记中,有35个被添加到鲢SSR-AFLP性别平均连锁图谱上。长约2 kb的片段比长约1 kb的片段更适用于InDel-RFLP标记开发。设计特异引物,扩增基因组片段,用4种限制性内切酶(BsuR I、Hha I、Taq I和Vsp I)之一切成适宜聚丙烯酰胺凝胶电泳分离的小片段,电泳分离、银染分型。该标记系统避免了对InDel精确定位的困难,通过高分辨PAGE分型,可为鲢连锁图谱构建和性状定位提供丰富的标记位点。

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