文献类型: 中文期刊
作者: 熊丹; 李敏; 李永振; 李玉芳; 张魁;
关键词: 种群判别;短尾大眼鲷;细胞色素b;南海
期刊名称: 中国水产科学
ISSN: 1005-8737
年卷期: 2016 年 23 卷 01 期
页码: 188-197
收录情况: 北大核心 ; CSCD
摘要: 对采集于中国南海北部近岸和南沙西南部陆架海域7个采样点共246尾短尾大眼鲷(Priacanthus macracanthus)样品进行了线粒体细胞色素b基因(cytochrome b,cyt b)序列的扩增与分析,获得了长度为684 bp的同源序列。碱基A、T、C、G含量分别为22.7%、28.4%、33.4%、15.5%,共检测到多态位点92个,定义了90个单倍型。其遗传多样性表现出高单倍型多样性(0.8130~0.9012)和低核苷酸多样性(0.0040~0.0053)的特点。两两群体间的Fst分析显示,大部分群体间的Fst值均小于0.05,且差异不显著(P>0.05),样本总体分化指数仅为0.012,群体间分化程度很低。分子方差分析(AMOVA)表明,群体间的遗传变异仅占总遗传变异的1.25%,98.75%的遗传变异源于群体内,群体之间有较高的遗传同质性。基于邻接法构建的系统发育树和基于中间连接法构建的单倍型网络图均显示,南海短尾大眼鲷不存在与地理群体对应的支系,遗传分化不显著。中性检测和不对称分布分析发现,南海短尾大眼鲷群体在更新世晚期发生过种群扩张。结果表明南海短尾大眼鲷群体间的遗传交流较频繁,可以认为是一个大的种群。
- 相关文献
[1]南海短尾大眼鲷的种群遗传结构分析. 熊丹,李敏,陈作志,李永振,李玉芳,黄梓荣. 2015
[2]北部湾短尾大眼鲷生长和死亡参数的估算. 孙典荣,邱永松. 2003
[3]基于海表温和水深的南海北部短尾大眼鲷渔场分析. 范江涛,黄梓荣,许友伟,孙铭帅,晏然,陈作志. 2019
[4]北部湾短尾大眼鲷生长死亡和最佳开捕规格估算. 孙典荣,邱永松. 2003
[5]基于线粒体cytb序列的花斑蛇鲻种群遗传结构研究. 李敏,黄梓荣,许友伟,陈作志. 2019
[6]6种笛鲷属鱼类Cyt b基因片段序列的比较. 周发林,江世贵,苏天凤,吕俊霖. 2004
[7]8种鲤养殖品种线粒体Cyt b基因的遗传多样性和系统进化分析. 肖同乾,鲁翠云,李超,张明昭,顾颖,孙效文. 2013
[8]基于mtDNA Cytb序列分析养殖与野生刀鲚群体的遗传多样性. 魏广莲,徐钢春,顾若波,李建林,徐跑. 2012
[9]二长棘犁齿鲷线粒体细胞色素b基因序列和分子系统发育分析. 张殿昌,邵燕卿,苏天凤,江世贵. 2007
[10]刀鲚与湖鲚线粒体细胞色素b基因片段多态性及遗传关系. 程起群,温俊娥,王云龙,韩金娣,卢大儒. 2006
[11]利用COⅠ和Cytb序列探讨东海区3种鲳属鱼类的种群遗传结构. 孙鹏,彭士明,尹飞,施兆鸿. 2011
[12]剑尾鱼线粒体细胞色素b基因的序列分析. 叶星,白俊杰,劳海华,简清,吴淑勤. 2002
[13]草鱼线粒体细胞色素b基因的克隆与序列分析. 叶星,白俊杰,劳海华,简清,罗建仁. 2002
[14]3种白鲑线粒体细胞色素b和16S rRNA基因片段序列分析. 张俊丽,高天翔,韩志强,郭焱,董崇智. 2007
[15]盘丽鱼属鱼类线粒体DNA细胞色素b基因序列和亲缘关系分析. 张静,白俊杰,叶星,劳海华,简清,罗建仁. 2005
[16]基于线粒体细胞色素b基因片段序列变异探讨3种鲳属鱼类系统进化. 马春艳,赵峰,孟彦羽,施兆鸿,庄平,赵云龙. 2009
[17]4种鲷科鱼类的线粒体细胞色素b基因序列及分子系统学分析. 江世贵,刘红艳,苏天凤,龚世园. 2003
[18]胭脂鱼细胞色素b基因序列测定及亚口鱼科系统进化分析. 张丽丽,万全,程起群. 2011
[19]基于线粒体Cyt b基因的黄海南部和东海银鲳群体遗传结构分析. 赵峰,庄平,章龙珍,施兆鸿. 2011
[20]怒江流域多鳞荷马条鳅(Homatula pycnolepis)种群年龄结构与遗传多样性. 岳兴建,刘绍平,刘明典,段辛斌,汪登强,陈大庆. 2013
作者其他论文 更多>>
-
基于长度数据的南海北部深水金线鱼资源评估
作者:刘子凯;许友伟;蔡研聪;孙铭帅;张魁;陈作志
关键词:深水金线鱼;资源评估;数据缺乏;不确定性;资源量;繁殖潜力比
-
基于DNA条形码技术的大亚湾春季鱼卵种类组成研究
作者:胡凯;李敏;张帅;蒋佩文;蔡研聪;陈作志;徐姗楠
关键词:DNA条形码;鱼卵;种类组成;大亚湾
-
南海北部渔业生物声学密度的底表层间差异及与多类非生物因子的相关性分析
作者:孙铭帅;蔡研聪;张魁;许友伟;杨玉滔;陈作志
关键词:非生物因子;极限梯度提升算法(XGBoost);随机森林(Random Forest);渔业声学;南海北部
-
南海区拖网渔业发展趋势及其对渔业资源的影响
作者:粟丽;许友伟;张魁;陈作志
关键词:拖网渔业;南海区;捕捞;幼鱼;发展建议
-
利用环境DNA技术探测南海西沙鲸类物种多样性
作者:麦俊晓;张帅;郑若丹;王腾;赖晓芳;蒋佩文;王文欣;陈作志;李敏
关键词:环境DNA;通用引物;鲸类;物种多样性;西沙;南海
-
拉尼娜事件前后北部湾鱼类群落结构变化研究
作者:李淼;许友伟;孙铭帅;范江涛;李佳俊;张魁;陈作志
关键词:拉尼娜事件;鱼类群落;生物多样性;优势种;北部湾
-
长江江豚监测现状及展望
作者:陈炳耀;信誉;路方婷;孙婧;刘杉;李敏;吴斌;王崇瑞;张衡;周玉香;白玲
关键词:长江江豚;种群监测;截线抽样法;环境DNA;保护管理