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猪CAPN2基因的生物信息学分析

文献类型： 中文期刊

作者： 王学敏 1 ; 李碧侠 1 ; 任守文 1 ;

作者机构： 1.江苏省农业科学院畜牧研究所

关键词： 猪;CAPN2基因;电子克隆;生物信息学

期刊名称： 江苏农业科学

ISSN： 1002-1302

年卷期： 2008 年 01 期

页码： 164-167

收录情况： 北大核心

摘要： CAPN2基因对肌原纤维蛋白的降解起重要作用,在肉熟化过程中可能参与肉的嫩化过程。本研究通过生物信息学方法,对猪CAPN2基因进行了电子克隆,获得了3 150 bp的cDNA全长序列,含有一个编码700个氨基酸的完整开放阅读框架。通过序列同源比对发现,该基因的核苷酸和氨基酸水平与人、大鼠及小鼠都具有较高的同源性。在序列多重比较的基础上,分别进行了基因与蛋白质的系统发育树分析,结果表明,该基因与其编码蛋白的聚类结果具有一致性。此外,蛋白质性质与功能的生物信息学分析显示,该基因编码的蛋白是一种等电点为4.87的水溶性稳定蛋白,定位于细胞质,属于非分泌性蛋白,具有跨膜螺旋结构以及钙蛋白酶类催化基序结构。

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