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羊口疮病毒疫苗株和ORFV-PN株ORFV011基因的比较分析

文献类型： 中文期刊

作者： 林裕胜 1 ; 江锦秀 1 ; 张靖鹏 1 ; 游伟 1 ; 胡奇林 1 ;

作者机构： 1.福建省农业科学院畜牧兽医研究所

关键词： 羊口疮病毒;疫苗株;ORFV-PN;ORFV011基因

期刊名称： 福建农业学报

ISSN： 1008-0384

年卷期： 2020 年 002 期

页码： 124-129

收录情况： CSCD

摘要： [目的]比较分析羊口疮病毒疫苗株与ORFV-PN株ORFV011基因的分子特点、编码蛋白的生物学功能差异,为福建省羊口疮的科学防控提供理论指导.[方法]对羊口疮疫苗株和ORFV-PN株ORFV011基因进行克隆和测序,运用生物信息学相关软件比较分析两者测序结果的差异.[结果]测序结果显示,疫苗株和ORFV-PN株ORFV011基因均由1 137个核苷酸组成,编码378个氨基酸.核苷酸序列和氨基酸序列相似性比较显示,ORFVPN与疫苗株和弱毒株D1701株ORFV011基因核苷酸序列相似性分别为98.6%和98.4%,氨基酸序列相似性均为98.7%.与疫苗株相比,ORFV-PN株共有16处核苷酸变异和5处氨基酸变异.在蛋白二级结构上,ORFV-PN株和疫苗株α-螺旋占比分别为34.13%(129/378)和30.42%(115/378),β-转角占比分别为6.08%(23/378)和6.88%(26/378),无规则卷曲占比分别为37.30%(141/378)和39.15%(148/378),β-折叠占比分别为22.49%(85/378)和23.54%(89/378).蛋白三级结构上,ORFV-PN株预测的三维结构与疫苗株的三维结构在α-螺旋和无规则卷曲上有一定的差异.[结论]福建省羊口疮病毒ORFV011基因出现变异,应当引起广大兽医工作者的重视,有关部门应当加强对羊口疮的监测.

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[1]羊口疮病毒闽侯株的分离和初步鉴定. 林甦,林裕胜,江斌,江锦秀,陈梅娇,胡奇林. 2014

[2]福建省羊口疮的流行病学调查与PCR诊断. 董晓宁,李文杨,刘远,高承芳,张晓佩,林碧芬. 2013

[3]4份临床样品中羊口疮病毒F1L、B2L和GIF基因的进化分析. 林裕胜,刘维巍,张龙,江锦秀,张靖鹏,刘庆华,胡奇林. 2022

[4]羊传染性脓疱病毒福州株的分离和初步鉴定. 林甦,林裕胜,江斌,江锦秀,陈梅娇,胡奇林. 2015

[5]羊口疮病毒和丝状支原体簇双重PCR检测方法的建立及应用. 林裕胜,江锦秀,江斌,游伟,胡奇林. 2017

[6]羊口疮病毒115基因的克隆及原核表达. 林裕胜,黄丽丽,江锦秀,张靖鹏,刘维巍,刘庆华,胡奇林. 2022

[7]鸭肠炎病毒疫苗株EvaGreen实时荧光定量PCR方法的建立. 万春和,刘荣昌,程龙飞,傅光华,施少华,陈红梅,傅秋玲,黄瑜. 2018

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