文献类型： 中文期刊

作者： 唐标 ¹ ; 吴静 ¹ ; 王静鸽 ¹ ; 郑雪 ¹ ; 吉小凤 ¹ ; 钱鸣蓉 ¹ ; 杨华 ¹ ;

作者机构： 1.浙江省农业科学院农产品质量安全危害因子与风险防控国家重点实验室

关键词： 肉鸡;蛋鸡;粪便;高通量测序;菌群结构;16 S核糖体DNA

期刊名称： 家畜生态学报

ISSN： 1673-1182

年卷期： 2022 年 43 卷 009 期

页码： 21-27

收录情况： 北大核心

摘要： 为探究蛋鸡和肉鸡粪便中微生物的差异性,本试验采用高通量测序的方法,对浙江省部分地区蛋鸡和肉鸡53份粪便样品的16 S rDNA的V3-V4区进行菌群结构研究,在门和属水平上进行了菌群α多样性对比分析及组间差异对比分析.结果表明:微生物群落组成分析显示,在门水平上,厚壁菌门(Firmicutes)、变形菌门(Proteobacteria)和拟杆菌门(Bacte-roidetes)为此次样品中的主要优势菌群;在属水平上,主要优势菌群为埃希氏菌-志贺氏菌(Escherichia-Shigella)、消化链球菌(Peptostreptococcus)、螺杆菌(Helicobacter)和拟杆菌(Bacteroides).α多样性结果表明,蛋鸡粪便的菌群多样性大于肉鸡.在门水平上,变形菌门、梭杆菌门(Fusobacterium)、互养菌门(Synergistetes)、黏胶球形菌门(Lentisphaerae),在属水平上,埃希氏菌-志贺氏菌、螺杆菌属的相对丰度在两组样品之间的差异极显著(P<0.01).说明基于16S rDNA扩增子测序对蛋鸡和肉鸡粪便的微生物菌群进行对比分析,结合饲养环境和饲养方式等因素,可以阐释蛋鸡和肉鸡粪便菌群的差异性.