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咖啡ISSR与RAPD-PCR反应体系优化

文献类型： 中文期刊

作者： 闫林 1 ; 黄丽芳 1 ; 谭乐和 1 ; 范睿 1 ; 王晓阳 1 ; 陈鹏 1 ; 董云萍 1 ;

作者机构： 1.中国热带农业科学院香料饮料研究所

关键词： 咖啡;ISSR;RAPD;均匀设计;体系优化

期刊名称： 热带作物学报

ISSN： 1000-2561

年卷期： 2012 年 33 卷 05 期

页码： 79-84

收录情况： CSCD

摘要： 以中粒种咖啡部分种质为试材,采用U25(55)均匀设计表,对影响ISSR和RAPD标记的模板DNA、Mg2+、dNTPs、TaqDNA聚合酶和引物浓度5个因素进行优化,分别建立适合于中粒种咖啡ISSR-PCR和RAPD-PCR标记的反应体系。结果表明:2种标记的反应体系相似,20μL的反应体系中含DNA模板20 ng,Mg2+1.5 mmol/L,dNTPs 0.3 mmol/L,Taq酶1.25 U,引物0.6μmol/L。利用所确立的体系对13份中粒种咖啡种质进行扩增,结果条带清晰明亮,多态性好。

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