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番茄SBP基因家族的全基因组鉴定、结构特征及表达分析

文献类型： 中文期刊

作者： 万红建 1 ; 袁伟 1 ; 俞锞 1 ; 刘云飞 1 ; 李志邈 1 ; 叶青静 1 ; 王荣青 1 ; 阮美颖 1 ; 周国治 1 ; 姚祝平 1 ; 杨悦俭 1 ;

作者机构： 1.浙江省农业科学院蔬菜研究所

关键词： 番茄;SBP基因家族;生物信息学;水稻;拟南芥

期刊名称： 分子植物育种

ISSN： 1672-416X

年卷期： 2013 年 003 期

页码： 299-306

收录情况： 北大核心 ; CSCD

摘要： SBP基因家族是植物中一类特有的转录因子家族,广泛参与植物的生长发育以及各种生理生化反应的信号传导.为了揭示番茄SBP基因家族的功能,本研究利用全基因组信息鉴定番茄SBP转录因子家族,分析其结构特征,系统发育关系以及表达模式.结果表明,番茄全基因组共编码17个SBP转录因子成员,分布在8条染色体上;系统发育关系表明SBP基因家族的结构特征变异发生在番茄、拟南芥和水稻分化之前;且它们在番茄、拟南芥和水稻中按照物种特异性的方式进行了扩张.不同芯片分析发现,SlSBP03基因在番茄叶片、子叶和下胚轴中表达量较高,SlSBP13基因果肉中表达量较高,这两个基因在果皮和根中表达量都较低;在大多数非生物胁迫处理条件下,SlSBP11、SlSBP13和SlSBP16的表达量均较低;而SlSBP01基因在干旱和热处理条件下有较高的表达量.

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